More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1784 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1784  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 325 aa  661    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_570  D-alanine--D-alanine ligase  31.72 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0629  D-ala D-ala ligase  29.66 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  30.32 
 
 		 663 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0602  D-alanine--D-alanine ligase  29.47 
 
 		 338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1506  D-alanine--D-alanine ligase  29.48 
 
 		 728 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.736453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1410  D-alanine--D-alanine ligase  29.48 
 
 		 728 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.801372  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0081  D-alanine--D-alanine ligase  31.92 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.201322  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 637 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2449  D-alanine--D-alanine ligase  28.66 
 
 		 727 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1418  D-alanine--D-alanine ligase  30.37 
 
 		 731 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2749  D-alanine--D-alanine ligase  26.3 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1551  D-alanine--D-alanine ligase  32.07 
 
 		 344 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0372534 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  33.06 
 
 		 743 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  29.87 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  32.11 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  31.43 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  31.71 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  32.11 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  30.89 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  31.71 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  30.89 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  30.79 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  31.3 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  31.71 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  31.71 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0135  D-alanine--D-alanine ligase  30.08 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  28.25 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  31.3 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  31.02 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  30.1 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  28.46 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3042  D-alanine--D-alanine ligase  27.37 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  31.75 
 
 		 319 aa  106  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1775  D-alanine--D-alanine ligase domain protein  29.04 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.286204  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  32.7 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  26 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  31.17 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0712  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  27.76 
 
 		 326 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.396337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  29.53 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2842  D-alanine--D-alanine ligase  29.8 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3425  D-alanine--D-alanine ligase  31.4 
 
 		 304 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.346126  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  28.28 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0524  D-alanine--D-alanine ligase  33.64 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.860729 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  30 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  29.73 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  31.06 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  28.57 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  27.21 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  30.6 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  29.96 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3415  D-alanine--D-alanine ligase  29.84 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0675936  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  30.48 
 
 		 302 aa  96.3  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  29.13 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  30.24 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  30.66 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  27.16 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  30.14 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  29.2 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  29.34 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  27.16 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  27.57 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  27.27 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  29.11 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  29.88 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  28.63 
 
 		 339 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1724  hypothetical protein  27.2 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.92014  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  29.33 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  33.01 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2162  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  25 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  33.01 
 
 		 301 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  23.61 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  27.65 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  27.65 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  26.77 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  28.11 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6426  D-alanine/D-alanine ligase  26.89 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  23.61 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  30.29 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  27.65 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  28.37 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  27.3 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  28.94 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39720  D-alanine--D-alanine ligase  25.65 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  27.34 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  25.51 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  25.7 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  27.34 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  27.42 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  29.79 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  27.53 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  27.34 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  25.51 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0772  D-alanine--D-alanine ligase  25.94 
 
 		 309 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  32.11 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  28.92 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  27.73 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  27.4 
 
 		 376 aa  87  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  26.29 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  24.63 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>