More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1506 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1410  D-alanine--D-alanine ligase  99.59 
 
 		 728 aa  1458    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.801372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2449  D-alanine--D-alanine ligase  97.39 
 
 		 727 aa  1318    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1418  D-alanine--D-alanine ligase  86.64 
 
 		 731 aa  1169    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1506  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 728 aa  1462    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.736453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  45.9 
 
 		 347 aa  295  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0629  D-ala D-ala ligase  41.09 
 
 		 338 aa  247  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0602  D-alanine--D-alanine ligase  40.48 
 
 		 338 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_570  D-alanine--D-alanine ligase  40.18 
 
 		 338 aa  243  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1775  D-alanine--D-alanine ligase domain protein  42.51 
 
 		 331 aa  242  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.286204  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3042  D-alanine--D-alanine ligase  37.94 
 
 		 349 aa  216  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0712  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  38.34 
 
 		 326 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.396337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2749  D-alanine--D-alanine ligase  35.88 
 
 		 338 aa  191  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0081  D-alanine--D-alanine ligase  33.88 
 
 		 310 aa  190  8e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.201322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0135  D-alanine--D-alanine ligase  36.59 
 
 		 336 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  34.52 
 
 		 743 aa  178  4e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1551  D-alanine--D-alanine ligase  31.44 
 
 		 344 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0372534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2162  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  32.42 
 
 		 339 aa  144  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 637 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2222  hypothetical protein  32.6 
 
 		 354 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  35.02 
 
 		 305 aa  137  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  35.55 
 
 		 318 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  35.23 
 
 		 318 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  35.23 
 
 		 318 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1784  D-alanine--D-alanine ligase  30.33 
 
 		 325 aa  132  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  34.55 
 
 		 318 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  36.33 
 
 		 319 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  34.01 
 
 		 663 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  32.03 
 
 		 309 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1724  hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  128  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.92014  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  32.79 
 
 		 324 aa  127  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0772  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 		 309 aa  127  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170719  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  33.02 
 
 		 315 aa  126  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  34.9 
 
 		 319 aa  125  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  32.31 
 
 		 319 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  31.88 
 
 		 313 aa  120  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  30.72 
 
 		 333 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  31.65 
 
 		 319 aa  119  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  34.36 
 
 		 314 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  30.07 
 
 		 308 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  28.62 
 
 		 366 aa  118  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  29.32 
 
 		 308 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  29.32 
 
 		 308 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  34.65 
 
 		 301 aa  117  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  30.9 
 
 		 310 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  31.54 
 
 		 324 aa  117  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  28.21 
 
 		 314 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  30.94 
 
 		 359 aa  117  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  32.55 
 
 		 346 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  31.48 
 
 		 306 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  30.23 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  30.37 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  34.62 
 
 		 304 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  27.49 
 
 		 376 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  29.66 
 
 		 317 aa  116  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  31.85 
 
 		 314 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3425  D-alanine--D-alanine ligase  34.66 
 
 		 304 aa  115  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.346126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  28.36 
 
 		 367 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  31.23 
 
 		 327 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0526  D-alanine--D-alanine ligase  29.96 
 
 		 332 aa  115  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000337974  hitchhiker  0.0000125004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  32.74 
 
 		 330 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  32.5 
 
 		 319 aa  115  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 		 327 aa  114  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  34.82 
 
 		 302 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  29.35 
 
 		 369 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  34.04 
 
 		 365 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  28.72 
 
 		 366 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  30.94 
 
 		 342 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  27.08 
 
 		 364 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  27.08 
 
 		 364 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  27.08 
 
 		 364 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  27.08 
 
 		 364 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  29.68 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  27.08 
 
 		 364 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  27.08 
 
 		 364 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  30.74 
 
 		 348 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  27.08 
 
 		 364 aa  113  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  31.5 
 
 		 364 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  27.08 
 
 		 364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4584  D-alanine--D-alanine ligase  33.81 
 
 		 326 aa  112  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.984407  hitchhiker  0.000547053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  29.35 
 
 		 313 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  28.97 
 
 		 363 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  30.27 
 
 		 308 aa  111  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  34.47 
 
 		 316 aa  111  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2638  D-alanine--D-alanine ligase  31.42 
 
 		 311 aa  111  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.482426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  31.2 
 
 		 308 aa  111  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  29.26 
 
 		 367 aa  110  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1501  hypothetical protein  30.85 
 
 		 348 aa  110  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  28.76 
 
 		 308 aa  110  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  27.99 
 
 		 366 aa  110  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  28.71 
 
 		 312 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1204  D-alanine--D-alanine ligase  32.2 
 
 		 301 aa  110  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2858  D-alanine--D-alanine ligase  29.1 
 
 		 316 aa  109  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000136858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  28.26 
 
 		 364 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  31.2 
 
 		 340 aa  109  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  31.71 
 
 		 331 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  29.01 
 
 		 317 aa  108  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  32.95 
 
 		 331 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  25.96 
 
 		 365 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  28.86 
 
 		 306 aa  108  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  26.39 
 
 		 364 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>