More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1774 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1774  protein of unknown function DUF201  100 
 
 
340 aa  684    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119478  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3043  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  44.44 
 
 
351 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1891  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 
527 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0713  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  37.42 
 
 
357 aa  192  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323281  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1551  D-alanine--D-alanine ligase  29.26 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0372534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2162  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  26.53 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  27.66 
 
 
347 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2449  D-alanine--D-alanine ligase  30.13 
 
 
727 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1506  D-alanine--D-alanine ligase  29.81 
 
 
728 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.736453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1410  D-alanine--D-alanine ligase  29.81 
 
 
728 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.801372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1418  D-alanine--D-alanine ligase  30.45 
 
 
731 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  27.7 
 
 
663 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  28.14 
 
 
637 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  28.48 
 
 
308 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1501  hypothetical protein  31.13 
 
 
348 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2222  hypothetical protein  25.6 
 
 
354 aa  89.4  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0081  D-alanine--D-alanine ligase  26.09 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.201322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0135  D-alanine--D-alanine ligase  27.63 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  26.98 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1724  hypothetical protein  28.8 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.92014  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  29.79 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2749  D-alanine--D-alanine ligase  26.02 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  21.86 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2424  D-alanine--D-alanine ligase  27.05 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060178  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3943  D-alanine--D-alanine ligase  26.45 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0695  D-alanine--D-alanine ligase  28.37 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686209  normal  0.293576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  26.6 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  24.02 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  27.57 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  23.7 
 
 
743 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  27.73 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3042  D-alanine--D-alanine ligase  24.14 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7439  D-alanine--D-alanine ligase  26.55 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  27.34 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  26.64 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3660  D-alanine--D-alanine ligase  28.24 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  27.3 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  25.08 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  26.44 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  27.73 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  26.79 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  25.5 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  25.08 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  27.46 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  25.08 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  27.27 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  27.46 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  27.05 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  27.17 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  25 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  24.58 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  26.29 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  26.53 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  29.92 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  27.71 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  27.71 
 
 
306 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  27.71 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3167  D-alanine--D-alanine ligase  27.85 
 
 
315 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  27.53 
 
 
306 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  26.76 
 
 
357 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  27.71 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  27.24 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  27.71 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  27.45 
 
 
364 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  27.71 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1485  D-alanine/D-alanine ligase  28.52 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.209909  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1967  D-alanine--D-alanine ligase  25.35 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000254256  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  27.02 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  25.48 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  26.74 
 
 
324 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  26.83 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  27.02 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  27.31 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  28.28 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  27.02 
 
 
306 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2426  D-alanine--D-alanine ligase  27.3 
 
 
309 aa  63.5  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142396  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1427  D-alanyl-alanine synthetase A  24.9 
 
 
373 aa  63.5  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  25.1 
 
 
318 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1490  D-alanyl-alanine synthetase A  24.9 
 
 
372 aa  63.5  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2946  D-alanine--D-alanine ligase  25.5 
 
 
307 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  25.98 
 
 
368 aa  62.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  26.76 
 
 
366 aa  62.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  25.8 
 
 
311 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  26.32 
 
 
310 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  22.67 
 
 
340 aa  62.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3301  D-alanine--D-alanine ligase  24.35 
 
 
308 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  29.54 
 
 
314 aa  62.8  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0143  bifunctional D-alanyl-alanine synthetase A/UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.4 
 
 
833 aa  62  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.714064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  27.42 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  22.22 
 
 
376 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2496  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.71 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  28.05 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1055  D-alanine--D-alanine ligase  27.43 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  25.93 
 
 
314 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  25.49 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  27.8 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2046  D-alanine--D-alanine ligase  25 
 
 
320 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000802497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  25.51 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  23.36 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  23.83 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>