More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0655 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  69.95 
 
 		 637 aa  938    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 663 aa  1366    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2222  hypothetical protein  45.37 
 
 		 354 aa  279  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1724  hypothetical protein  39.42 
 
 		 343 aa  233  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.92014  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1501  hypothetical protein  36.9 
 
 		 348 aa  211  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  40.66 
 
 		 638 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  38.96 
 
 		 259 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1551  D-alanine--D-alanine ligase  35.13 
 
 		 344 aa  163  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0372534 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_570  D-alanine--D-alanine ligase  32.94 
 
 		 338 aa  153  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0629  D-ala D-ala ligase  31.85 
 
 		 338 aa  143  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0081  D-alanine--D-alanine ligase  34.4 
 
 		 310 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.201322  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0602  D-alanine--D-alanine ligase  33.1 
 
 		 338 aa  136  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0135  D-alanine--D-alanine ligase  29.81 
 
 		 336 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2749  D-alanine--D-alanine ligase  30.03 
 
 		 338 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2162  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  29.85 
 
 		 339 aa  132  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  31.21 
 
 		 347 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1784  D-alanine--D-alanine ligase  30.32 
 
 		 325 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1410  D-alanine--D-alanine ligase  34.05 
 
 		 728 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.801372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1506  D-alanine--D-alanine ligase  34.05 
 
 		 728 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.736453  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  31.51 
 
 		 743 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2449  D-alanine--D-alanine ligase  33.69 
 
 		 727 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1418  D-alanine--D-alanine ligase  33.7 
 
 		 731 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0712  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  29.13 
 
 		 326 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.396337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3042  D-alanine--D-alanine ligase  30.91 
 
 		 349 aa  113  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  27.8 
 
 		 308 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  27.8 
 
 		 308 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  31.15 
 
 		 312 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 252 aa  107  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  29.18 
 
 		 376 aa  107  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  32.49 
 
 		 261 aa  107  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  31.9 
 
 		 259 aa  106  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 262 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  28.73 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  27.17 
 
 		 383 aa  105  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  29.15 
 
 		 308 aa  105  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1775  D-alanine--D-alanine ligase domain protein  30.26 
 
 		 331 aa  104  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.286204  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7137  D-alanine--D-lactate ligase  31.4 
 
 		 348 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  29.78 
 
 		 675 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  30.86 
 
 		 308 aa  102  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 249 aa  101  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  31.66 
 
 		 251 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 252 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  30.36 
 
 		 308 aa  99.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  28.74 
 
 		 306 aa  98.6  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  29.03 
 
 		 304 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  26.6 
 
 		 311 aa  97.4  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  29.03 
 
 		 304 aa  97.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  29.03 
 
 		 304 aa  97.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  29.01 
 
 		 305 aa  96.3  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  27.89 
 
 		 311 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  29.03 
 
 		 304 aa  97.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  28.83 
 
 		 317 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  27.42 
 
 		 304 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  27.42 
 
 		 304 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  29.46 
 
 		 309 aa  95.5  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  28.38 
 
 		 361 aa  95.1  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  28.63 
 
 		 304 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  28.63 
 
 		 304 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  28.63 
 
 		 304 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  27.5 
 
 		 334 aa  94.7  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 250 aa  94.7  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  33.71 
 
 		 262 aa  94.4  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 		 262 aa  94  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  32.8 
 
 		 253 aa  93.6  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  30.45 
 
 		 346 aa  93.6  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  27.44 
 
 		 341 aa  93.2  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  28.06 
 
 		 360 aa  93.6  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  25.74 
 
 		 350 aa  93.2  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  28.35 
 
 		 306 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5793  D-alanine--D-lactate ligase  30.04 
 
 		 346 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1891  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 527 aa  92.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  34.01 
 
 		 253 aa  92.8  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  28.67 
 
 		 363 aa  92.8  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 250 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  27.41 
 
 		 367 aa  92.4  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 246 aa  92  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5946  D-alanyl-alanine synthetase A  26.97 
 
 		 329 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.588243  normal  0.0506502 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  27.2 
 
 		 364 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  27.53 
 
 		 310 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1774  protein of unknown function DUF201  27.2 
 
 		 340 aa  91.3  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119478  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0325  D-alanine--D-alanine ligase  27.18 
 
 		 306 aa  91.3  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0370314  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  26.98 
 
 		 332 aa  90.5  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  26.98 
 
 		 332 aa  90.5  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  29.64 
 
 		 342 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4584  D-alanine--D-alanine ligase  27.13 
 
 		 326 aa  89.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.984407  hitchhiker  0.000547053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 271 aa  90.1  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  27.67 
 
 		 306 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  27.64 
 
 		 324 aa  89.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  27.47 
 
 		 310 aa  89.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  28.52 
 
 		 358 aa  89.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  27.67 
 
 		 306 aa  89.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  26.95 
 
 		 338 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0713  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  30.26 
 
 		 357 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  27.67 
 
 		 306 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 255 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5356  D-alanine/D-alanine ligase  28.69 
 
 		 346 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315218  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0524  D-alanine--D-alanine ligase  29.05 
 
 		 329 aa  88.6  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.860729 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  26.88 
 
 		 306 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  26.88 
 
 		 306 aa  88.2  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  26.88 
 
 		 306 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>