More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1525 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  100 
 
 
251 aa  507  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
262 aa  122  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  27.84 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  28.79 
 
 
245 aa  118  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  31.56 
 
 
250 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  30.24 
 
 
262 aa  115  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
637 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
261 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 
675 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
257 aa  105  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  28 
 
 
264 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  29.64 
 
 
262 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  27.2 
 
 
259 aa  102  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  28.4 
 
 
253 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  31.66 
 
 
663 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  34.01 
 
 
304 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  25.19 
 
 
246 aa  99.4  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  30.04 
 
 
258 aa  95.9  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 
246 aa  95.5  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  32.37 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  24.9 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  29.23 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1128  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
257 aa  89  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  32.44 
 
 
315 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  32.75 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 
638 aa  83.6  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  24.42 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1833  methyltransferase type 11  31.44 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  30.9 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  25.33 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  28.39 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  28.19 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  28.74 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  28.38 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2097  Methyltransferase type 11  31.23 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2027  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  25.91 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1058  methyltransferase type 12  30.84 
 
 
254 aa  72  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  28.04 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  42.19 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  34.55 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  33.07 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38.6 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
319 aa  68.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  38.6 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  23.53 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  31.44 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  30.95 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  32.23 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  22.93 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  24.27 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  40.35 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 
286 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  31.79 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  25.35 
 
 
541 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  24.77 
 
 
541 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.27 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  26.6 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  34.97 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  25.96 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  29.05 
 
 
197 aa  62.8  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  26.51 
 
 
262 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  28.19 
 
 
189 aa  62.4  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  24.77 
 
 
541 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  30.62 
 
 
253 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  24.77 
 
 
541 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.06 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.2 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  39.29 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  24.77 
 
 
541 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 
291 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
283 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 
200 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
216 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  34.88 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  36.72 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
300 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  27.86 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.61 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.54 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  24.89 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>