191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1346 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  100 
 
 
258 aa  524  1e-148  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  74.61 
 
 
257 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1128  methyltransferase type 11  72.66 
 
 
257 aa  407  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  71.37 
 
 
257 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 
675 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  30.04 
 
 
251 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  26.48 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  25.1 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
252 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 
246 aa  79  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1833  methyltransferase type 11  27.8 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2097  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  23.64 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  28.52 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 
271 aa  72  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2027  Methyltransferase type 11  27.63 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  26.89 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  26.8 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  24.31 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  25.39 
 
 
637 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  23.55 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  28 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  23.71 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  25.7 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  27.38 
 
 
253 aa  62.4  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 
244 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  24.9 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  25.91 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  26.16 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  26.7 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  32.48 
 
 
663 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  24.61 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  21.95 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.28 
 
 
201 aa  56.2  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  24.02 
 
 
280 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  23.74 
 
 
262 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
244 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  22.83 
 
 
243 aa  55.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  22.49 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  25.39 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
352 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.91 
 
 
261 aa  52.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  19.6 
 
 
247 aa  52  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  23.85 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
363 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.66 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  36.9 
 
 
575 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  24.22 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  31.71 
 
 
251 aa  49.7  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  24.35 
 
 
261 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  25.79 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
327 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  23.71 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.29 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  23.02 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 
351 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.24 
 
 
240 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
249 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  23.15 
 
 
251 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2020  methyltransferase type 11  28.17 
 
 
230 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  27.51 
 
 
315 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1722  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
259 aa  47  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0192579  decreased coverage  0.00000164865 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  22.87 
 
 
638 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1831  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32.61 
 
 
370 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.59 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  26.85 
 
 
351 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 
711 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.59 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3915  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.21 
 
 
251 aa  46.2  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.59 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  25 
 
 
351 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6684  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.78 
 
 
230 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00241192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.05 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  26.85 
 
 
351 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2192  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  32 
 
 
383 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0331221  hitchhiker  0.00000592673 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
208 aa  46.2  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  35.59 
 
 
256 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  27.36 
 
 
351 aa  46.2  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  31.36 
 
 
271 aa  45.8  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
234 aa  45.8  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  23.77 
 
 
244 aa  45.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.1 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  32.48 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  49.23 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 
362 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  25.11 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.9 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.94 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  28.78 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>