165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0343 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  100 
 
 		 575 aa  1118    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1854  methyltransferase type 12  48.06 
 
 		 314 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.576643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0294  hypothetical protein  49.36 
 
 		 320 aa  263  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292114  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3746  hypothetical protein  46.77 
 
 		 314 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0250  hypothetical protein  48.4 
 
 		 321 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0868392  normal  0.167663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3023  methyltransferase type 12  44.12 
 
 		 321 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1465  hypothetical protein  41.74 
 
 		 334 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  35.74 
 
 		 253 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  35.18 
 
 		 262 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  34.77 
 
 		 262 aa  120  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  35.18 
 
 		 253 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  32.55 
 
 		 258 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 252 aa  96.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 251 aa  91.3  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 246 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 254 aa  88.2  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  35.32 
 
 		 256 aa  88.2  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 		 251 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  30.4 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  32.31 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  35.81 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  23.39 
 
 		 263 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  34.66 
 
 		 247 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  28.46 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  26.91 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  28.86 
 
 		 253 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 254 aa  72.8  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  23.77 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  23.77 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  23.36 
 
 		 261 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  22.95 
 
 		 261 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  23.36 
 
 		 261 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  38.33 
 
 		 238 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  27.64 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1639  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 242 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.197359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  29.11 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  23.47 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  24.29 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  23.48 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.82 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  25.93 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  22.8 
 
 		 276 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 239 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  21.86 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 269 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  28.29 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  24.55 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  33.9 
 
 		 254 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  26.79 
 
 		 259 aa  55.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 262 aa  55.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  26.01 
 
 		 254 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl078  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  27.56 
 
 		 307 aa  55.1  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0153588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  26.01 
 
 		 254 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  22.52 
 
 		 256 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  23.21 
 
 		 250 aa  55.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  25.51 
 
 		 231 aa  54.7  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 242 aa  55.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  26.01 
 
 		 254 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  28.51 
 
 		 250 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  28.51 
 
 		 250 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  28.29 
 
 		 250 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  26.01 
 
 		 254 aa  54.3  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  26.01 
 
 		 254 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 257 aa  54.3  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  18.34 
 
 		 232 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 246 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  25.56 
 
 		 254 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 247 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 249 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1366  hypothetical protein  29.57 
 
 		 220 aa  52  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.229777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 249 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  23.18 
 
 		 272 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 269 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  24.9 
 
 		 251 aa  52  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  26.01 
 
 		 261 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  25.13 
 
 		 233 aa  51.2  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 249 aa  51.6  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41071  predicted protein  24.82 
 
 		 342 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.762931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  23.97 
 
 		 249 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  21.74 
 
 		 239 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  22.83 
 
 		 239 aa  51.2  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 270 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 246 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  23.97 
 
 		 249 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4287  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 259 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  27.43 
 
 		 255 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  25 
 
 		 280 aa  50.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  23.26 
 
 		 246 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.54 
 
 		 232 aa  50.4  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 241 aa  50.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  25.11 
 
 		 254 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3478  hypothetical protein  25.85 
 
 		 257 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0815915 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  25.11 
 
 		 253 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 248 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 241 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  35.64 
 
 		 237 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 258 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 244 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>