200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3137 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  59 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  55.28 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  54.34 
 
 		 254 aa  221  9e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  51.13 
 
 		 247 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  48.13 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1639  Methyltransferase type 11  50.24 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.197359 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  46.94 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  37.5 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  40.48 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  33.6 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  33.18 
 
 		 575 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6712  methyltransferase type 12  32.91 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  33.69 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  30.26 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  28.73 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  35.92 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  35.92 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  35.92 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  35.92 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  35.92 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  35.92 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  35.92 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  33.98 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  24.06 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  24.53 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  33.98 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  40.38 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  24.3 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  23.83 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  24.3 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  24.76 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  27.09 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  23.11 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  23.11 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  26.06 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  25.35 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  25.35 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  23.73 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7688  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  0.423955 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  25.35 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  25.35 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  25.11 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.69 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  26.39 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  25.35 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  24.65 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl078  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  21.38 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0153588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  26.06 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  33.08 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  31.48 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0205  hypothetical protein  29.03 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0716517  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  26.85 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  23.15 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  26.87 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  29.13 
 
 		 416 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0182  hypothetical protein  34.82 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.168407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 304 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  27.14 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  42.05 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  23.94 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  26.22 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  22.92 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2606  hypothetical protein  28.68 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  26.63 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  28.19 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.21 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  38.69 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  26.94 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 286 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 202 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  28.41 
 
 		 294 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  29.82 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.37 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 218 aa  48.9  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>