More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31310 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  62.33 
 
 		 249 aa  261  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  54.51 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  50.21 
 
 		 260 aa  209  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  54.55 
 
 		 249 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44.21 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.712689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  44.04 
 
 		 246 aa  157  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.64 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  38.25 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  38.25 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  36.87 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  36.7 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.27 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  36.87 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  34.08 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  36.41 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  36.41 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  38.33 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  31.84 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  29.74 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  30.18 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  29.08 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  29.08 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  25.22 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  29.08 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  29.08 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  29.08 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  28.37 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  32.11 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  35.14 
 
 		 575 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  32.17 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.4 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  25.85 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.9 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  31.25 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  23.39 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  31.67 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  33.61 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  25.56 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  21.83 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  25.24 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.21 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  29.25 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  38.74 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  24.43 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  29.5 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.2 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.846293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.31 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  23.66 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.9 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 178 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  37.18 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.9 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.08 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 252 aa  52  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  31.82 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  23.64 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.29 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  33.65 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.9 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.65 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 362 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25.19 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  31.82 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  31.82 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  31.82 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  31.82 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  31.82 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 457 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>