More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0736 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  100 
 
 		 208 aa  430  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  34.34 
 
 		 575 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 560 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  35.27 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 585 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2119  methyltransferase type 12  34.31 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2356  methyltransferase type 12  33.82 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0212873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2105  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2240  methyltransferase type 12  33.82 
 
 		 226 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.39948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2265  methyltransferase type 12  30.52 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  31.68 
 
 		 586 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  36.36 
 
 		 535 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  38.71 
 
 		 522 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  29.27 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  35.82 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  35.07 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  35.07 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  35.07 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  35.07 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  35.07 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  34.33 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  39.33 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  27.42 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  34.62 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  31.78 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  33 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  31.78 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  31.78 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  31.78 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  31.78 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  31.78 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  29.25 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  34.96 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  25.27 
 
 		 551 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  41.33 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  30.84 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  33.03 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  25.33 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  23.39 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  26.9 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  27.75 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2599  tellurite resistance protein TehB  35.96 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  33.04 
 
 		 2112 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  25.51 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  26.53 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1392  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.69 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0145  thiopurine S-methyltransferase  36.59 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.25 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  25 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  27.42 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.66 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  33.98 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 364 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 		 326 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  35.44 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.37 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  30.1 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  35.09 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  29.84 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  38.03 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3813  methyltransferase type 12  32.38 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.59 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 279 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  22.77 
 
 		 1287 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  29.46 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.59 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  24.54 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 246 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.96 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  31.63 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  36.36 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  30.95 
 
 		 292 aa  52.4  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>