148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0872 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  100 
 
 
214 aa  421  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  56.35 
 
 
212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  50 
 
 
198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  45.41 
 
 
236 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
575 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  35.03 
 
 
201 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  35.27 
 
 
208 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  43.12 
 
 
560 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  48.12 
 
 
535 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2119  methyltransferase type 12  41.71 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.908555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2105  Methyltransferase type 12  41.14 
 
 
226 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497297  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2356  methyltransferase type 12  40.57 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0212873  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  41.77 
 
 
522 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2240  methyltransferase type 12  41.14 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.39948  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  41.14 
 
 
585 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  44.62 
 
 
202 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2265  methyltransferase type 12  36.41 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  32.54 
 
 
586 aa  89  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  38.68 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  30.66 
 
 
246 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  31.65 
 
 
214 aa  61.6  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  31.65 
 
 
214 aa  61.6  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
196 aa  58.9  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  30.63 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  40 
 
 
551 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  28.71 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  36.7 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
246 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  38.98 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  25.53 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  39.62 
 
 
423 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  24.04 
 
 
390 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  34.19 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  33.9 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  31.58 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  37.74 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  37.74 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  33.05 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  37.74 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  37.74 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  37.74 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
249 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  36.36 
 
 
249 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0145  thiopurine S-methyltransferase  28.21 
 
 
210 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285436  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  31.69 
 
 
208 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  34.62 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  23.94 
 
 
246 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  36.79 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  34.62 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  36.79 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  33.65 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
240 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  35.51 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  30.41 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1784  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 
214 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  37.86 
 
 
410 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  34.29 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  36.81 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  34.29 
 
 
196 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  30.17 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.86 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  24.29 
 
 
264 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  30.08 
 
 
253 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.16 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  36.79 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  29.41 
 
 
292 aa  46.2  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  34.27 
 
 
249 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  33.09 
 
 
364 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  34.27 
 
 
249 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
276 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1627  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
230 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  25.5 
 
 
195 aa  45.4  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  23.75 
 
 
192 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  29.08 
 
 
1287 aa  45.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  29.66 
 
 
255 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  31.13 
 
 
208 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  30.88 
 
 
211 aa  45.4  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  34.27 
 
 
249 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1267  methyltransferase type 12  36.59 
 
 
350 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  34.53 
 
 
201 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5088  methyltransferase type 12  35.11 
 
 
348 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0330  hypothetical protein  26.96 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  33.63 
 
 
243 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  22.53 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  36.52 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  37.27 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2485  hypothetical protein  29.17 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  19.46 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  46.43 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0974  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0947  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>