More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3370 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  73.63 
 
 		 203 aa  297  8e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  57.29 
 
 		 423 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  58.25 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  52.26 
 
 		 199 aa  205  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  57.61 
 
 		 201 aa  204  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  57.45 
 
 		 201 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  54.79 
 
 		 201 aa  201  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  54.55 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  54.55 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  54.55 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  55.38 
 
 		 201 aa  194  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  53.72 
 
 		 207 aa  186  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3123  MCP methyltransferase, CheR-type  54.97 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  51.65 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  53.33 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  53.19 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5057  Methyltransferase type 12  51.02 
 
 		 201 aa  160  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  42.39 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  40.53 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  39 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  37.29 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.59 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.81 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  44.19 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.05 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  34.86 
 
 		 541 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  34.86 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  34.86 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.06 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  46.27 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  34.86 
 
 		 541 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  29 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  34.23 
 
 		 541 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  36.7 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.69 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.69 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  31.48 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  31.48 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  31.48 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  30.56 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  40.86 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  44.12 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  30.56 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  41.79 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  27.66 
 
 		 263 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  31.13 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  31.13 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  36.44 
 
 		 304 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  50 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40.22 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  44.26 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  44.26 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.98 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  25 
 
 		 292 aa  53.1  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  30.19 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  36 
 
 		 254 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.37 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  30.19 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  30 
 
 		 269 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  26.78 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  22.37 
 
 		 267 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  46.15 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 575 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 		 540 aa  51.2  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  26.92 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  39.74 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  34.23 
 
 		 258 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  29.68 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  49.21 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 		 1171 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  28 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  45 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  46.43 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 		 319 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  40.21 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  33.98 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  39.05 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.04 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>