More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4890 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  100 
 
 
201 aa  394  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  82.91 
 
 
201 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  82.91 
 
 
201 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  82.91 
 
 
201 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  81.41 
 
 
201 aa  325  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  68.18 
 
 
201 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5057  Methyltransferase type 12  70.85 
 
 
201 aa  250  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  63.5 
 
 
207 aa  248  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  61.11 
 
 
201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  63.98 
 
 
423 aa  227  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  57.5 
 
 
201 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  57 
 
 
201 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  56.28 
 
 
199 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3123  MCP methyltransferase, CheR-type  61.96 
 
 
198 aa  201  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  54.79 
 
 
200 aa  201  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  57.71 
 
 
200 aa  197  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  54.82 
 
 
205 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  48.24 
 
 
203 aa  181  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  42.62 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  41.92 
 
 
259 aa  118  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  41.59 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
219 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  31.29 
 
 
246 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
252 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  36.94 
 
 
258 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  35.56 
 
 
200 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 
244 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  27.93 
 
 
247 aa  57.4  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  37.84 
 
 
238 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  33.33 
 
 
390 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
250 aa  55.5  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  29 
 
 
237 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  30.91 
 
 
541 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  37.63 
 
 
541 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.84 
 
 
227 aa  55.1  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 
237 aa  55.1  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  41.18 
 
 
541 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  30 
 
 
254 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  30.91 
 
 
541 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  30.91 
 
 
541 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.81 
 
 
263 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  25.36 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  28.91 
 
 
253 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  27.03 
 
 
263 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 
228 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  30.97 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  30.97 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  30.97 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
249 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  30.97 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  30.97 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  30.97 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  30.97 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28.75 
 
 
238 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 
251 aa  52  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
540 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  42.62 
 
 
218 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
257 aa  52  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.53 
 
 
222 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
245 aa  52  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  37.14 
 
 
246 aa  51.6  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7298  hypothetical protein  30.43 
 
 
228 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  34.83 
 
 
217 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.21 
 
 
229 aa  51.6  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  37.27 
 
 
196 aa  51.2  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.07 
 
 
235 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  24.49 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.28 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  29.45 
 
 
258 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  24.49 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  39.68 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.67 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  29.81 
 
 
279 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  30.28 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  46.91 
 
 
246 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.01 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  30.21 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  34.23 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  40 
 
 
253 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.58 
 
 
238 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  36.28 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  31.82 
 
 
575 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
304 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  26.09 
 
 
272 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
476 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  58.14 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  38.1 
 
 
222 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2087  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
221 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.261869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
248 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
354 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  25.95 
 
 
291 aa  48.9  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
253 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  40.68 
 
 
400 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>