More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2432 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  100 
 
 		 259 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  44.34 
 
 		 201 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  42.4 
 
 		 423 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  42.53 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  41.67 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  42.01 
 
 		 200 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  41.97 
 
 		 199 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  45.27 
 
 		 195 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  38.46 
 
 		 200 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  40.47 
 
 		 207 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  38.43 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  42.13 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  40.72 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  40.72 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  40.72 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  41.75 
 
 		 205 aa  109  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3123  MCP methyltransferase, CheR-type  41.03 
 
 		 198 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  38.07 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  40.93 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  41.38 
 
 		 192 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5057  Methyltransferase type 12  37.95 
 
 		 201 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  33.33 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.93 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  34.05 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  31.58 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  34.51 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  35.92 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.89 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  33.33 
 
 		 410 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  41.96 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  30.08 
 
 		 541 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 226 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  30.08 
 
 		 541 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.45 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.74 
 
 		 232 aa  52.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  44.64 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  36.96 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl078  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  28.87 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0153588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.12 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.63 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  30.08 
 
 		 541 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 337 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  29.32 
 
 		 541 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  38.71 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  36.81 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  46.88 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35 
 
 		 155 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.4 
 
 		 390 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  34.19 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  53.49 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  29.58 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.56 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  29.58 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 208 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 210 aa  49.7  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  29.58 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  51.16 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  29.58 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 226 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  46.15 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  33.04 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  31.43 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  34.72 
 
 		 387 aa  48.9  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  28.87 
 
 		 261 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  35.22 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  28.87 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.78 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>