More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01310 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  66.17 
 
 		 201 aa  267  8e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  62.19 
 
 		 207 aa  250  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  59.7 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  59.7 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  59.7 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  61.11 
 
 		 201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  58.71 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  60.61 
 
 		 201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  57.07 
 
 		 201 aa  207  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  55.38 
 
 		 423 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5057  Methyltransferase type 12  57.21 
 
 		 201 aa  204  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  54.59 
 
 		 199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3123  MCP methyltransferase, CheR-type  55.22 
 
 		 198 aa  186  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  52.53 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  51.65 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  54.27 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  48.63 
 
 		 203 aa  173  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  44.2 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  38.43 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  37.22 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 540 aa  58.9  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  34.21 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.27 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  43.94 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  33.65 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  33.03 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  25.47 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 476 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  23.62 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  27.35 
 
 		 541 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  26.22 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  26.22 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  27.35 
 
 		 541 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 265 aa  52.8  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  27.35 
 
 		 541 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  27.35 
 
 		 541 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.11 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.65 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 996 aa  52.4  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  26.95 
 
 		 263 aa  52  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  26.96 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  25.32 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 259 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  26.22 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  26.96 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  27.35 
 
 		 541 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 250 aa  52  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 257 aa  52  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  26.22 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  26.22 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  23.93 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  23.93 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  23.93 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  23.93 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1175  Methyltransferase type 12  31.19 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  26.03 
 
 		 390 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.23 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  23.93 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  23.93 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  23.93 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  45.45 
 
 		 400 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  20.97 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  23.73 
 
 		 266 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 304 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  30.28 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.47 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  25.61 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1201  glycosyltransferase  28.19 
 
 		 476 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0256337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  34.48 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  28.3 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  30.65 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  48.15 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  30 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  22.22 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.34 
 
 		 260 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.09 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  25.61 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  36.89 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  29.03 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  26.04 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  34.21 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>