More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14310 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  100 
 
 
203 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  73.63 
 
 
200 aa  297  8e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  56.35 
 
 
423 aa  215  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  51.72 
 
 
199 aa  198  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  53.4 
 
 
201 aa  191  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  52.36 
 
 
201 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  50 
 
 
201 aa  182  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  48.24 
 
 
201 aa  181  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  50 
 
 
201 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  50 
 
 
207 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  48.92 
 
 
201 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  48.92 
 
 
201 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  48.92 
 
 
201 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  48.63 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3123  MCP methyltransferase, CheR-type  51.28 
 
 
198 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  50.79 
 
 
205 aa  160  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  50.75 
 
 
200 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5057  Methyltransferase type 12  48.21 
 
 
201 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  39.89 
 
 
192 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  38.07 
 
 
259 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  41.21 
 
 
195 aa  99  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  33.56 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  30.83 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  35.38 
 
 
541 aa  65.1  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  33.86 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
248 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  33.85 
 
 
541 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  33.85 
 
 
541 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  33.85 
 
 
541 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  33.85 
 
 
541 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  36.8 
 
 
254 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  41.12 
 
 
222 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  35.54 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.01 
 
 
390 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  32.2 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
257 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  36.11 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  23.43 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  40.19 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
254 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  27.04 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
540 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
241 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  25.68 
 
 
215 aa  52.4  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
241 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  24.66 
 
 
250 aa  52  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  28.47 
 
 
245 aa  51.6  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
244 aa  51.6  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
210 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  32 
 
 
246 aa  51.6  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
277 aa  51.2  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  29.91 
 
 
253 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.26 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  39.64 
 
 
251 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.98 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  34.95 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  39.44 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0498  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216878  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  29.73 
 
 
280 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  29.73 
 
 
280 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.35 
 
 
266 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  23.17 
 
 
254 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  28.93 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  38.16 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  35.51 
 
 
214 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3273  Methyltransferase type 12  24 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  33.33 
 
 
263 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
226 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  30.09 
 
 
220 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 
215 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.11 
 
 
224 aa  48.9  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
250 aa  48.5  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
280 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  33.01 
 
 
255 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  28.81 
 
 
237 aa  48.5  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
304 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.03 
 
 
241 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
211 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  33.98 
 
 
196 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
247 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.36 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  40 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
251 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  34.29 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  42.65 
 
 
223 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  28.15 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  29.91 
 
 
263 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  33.71 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.46 
 
 
257 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  22.76 
 
 
267 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
258 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>