More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4348 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  55.81 
 
 
217 aa  231  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  56.6 
 
 
217 aa  229  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  57.94 
 
 
217 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  56.07 
 
 
210 aa  222  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  58.25 
 
 
203 aa  222  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  47.44 
 
 
209 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  51.87 
 
 
208 aa  181  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  48.85 
 
 
218 aa  174  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  48.15 
 
 
209 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  49.53 
 
 
212 aa  168  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  45.97 
 
 
215 aa  168  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  45.88 
 
 
232 aa  147  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  44.05 
 
 
228 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  39.62 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  42.49 
 
 
222 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.7 
 
 
200 aa  121  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  40.98 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  39.56 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  40.19 
 
 
400 aa  117  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  36.14 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
219 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.86 
 
 
224 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  34.47 
 
 
204 aa  95.9  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  35.81 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  45.08 
 
 
121 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  31.25 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  30.87 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  31.97 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  29.27 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  30.2 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  33.16 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  32 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  33.98 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  33.98 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  33.98 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  33.98 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  33.98 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 
226 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  33.98 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
291 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 
264 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  31.17 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  30 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  34.25 
 
 
252 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
199 aa  58.5  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  41.58 
 
 
267 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  29.14 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  30.07 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  30.77 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
208 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.03 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.47 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  33.01 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.41 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.11 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.68 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.29 
 
 
263 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  26.49 
 
 
390 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  31.49 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  32.67 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 
220 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 
221 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
201 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 
204 aa  55.5  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
201 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
201 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  40 
 
 
258 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
201 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
1106 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  38.95 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.08 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  33.66 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.8 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.39 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  44.12 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.91 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
257 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  30 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
178 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  29.37 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>