More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2989 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  100 
 
 
232 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  49.21 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  45.83 
 
 
217 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  49.47 
 
 
222 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  46.52 
 
 
220 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  43.78 
 
 
217 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 
212 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  45.9 
 
 
218 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  45.27 
 
 
210 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  43.69 
 
 
209 aa  144  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  42.45 
 
 
215 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  46.02 
 
 
208 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  51.45 
 
 
203 aa  131  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  39.69 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.85 
 
 
224 aa  105  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  40.85 
 
 
228 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  44.3 
 
 
400 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40 
 
 
200 aa  97.4  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  44.44 
 
 
200 aa  92  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  35.53 
 
 
219 aa  86.3  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  47.06 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  45.1 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  43.48 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  34.3 
 
 
204 aa  82  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  32.87 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  32 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  38.53 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  38.46 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1969  methyltransferase type 11  23.37 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620087  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  38.53 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  38.53 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  38.53 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  38.53 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  38.53 
 
 
201 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
224 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  32.34 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  42.17 
 
 
205 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  26.62 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  31.14 
 
 
199 aa  59.7  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  39.56 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  24.04 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  35.29 
 
 
201 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  31.93 
 
 
267 aa  58.5  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  35.48 
 
 
253 aa  58.5  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  31.78 
 
 
196 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  34.76 
 
 
291 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  38.04 
 
 
319 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  53.7 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
270 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  26.29 
 
 
364 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
270 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  26.6 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
270 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  53.7 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  40.91 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
201 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  41.1 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.92 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
259 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  40.22 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  31.73 
 
 
196 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  31.5 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  30 
 
 
264 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  33.7 
 
 
253 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  33.63 
 
 
200 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.32 
 
 
263 aa  55.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
200 aa  55.5  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  38.04 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  38.04 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  38.04 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  30.11 
 
 
310 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  31.72 
 
 
280 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  33.9 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  34.87 
 
 
279 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  29.69 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  29.91 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  38.04 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  28.97 
 
 
400 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  36.96 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  36.96 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  32.86 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.07 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  37.63 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>