192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2718 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  100 
 
 
204 aa  408  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  53.43 
 
 
210 aa  197  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  37.81 
 
 
210 aa  118  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  34.63 
 
 
217 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
217 aa  94.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  34.2 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  35.2 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  35.52 
 
 
220 aa  91.3  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.38 
 
 
217 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.48 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.3 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  32.58 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  34.3 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  31 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  33.71 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  34.46 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  30.53 
 
 
263 aa  61.2  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.61 
 
 
296 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  30.5 
 
 
262 aa  55.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  27.83 
 
 
272 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  34.33 
 
 
400 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 
253 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 
268 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  38.82 
 
 
236 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  38.82 
 
 
236 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.14 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  38.82 
 
 
236 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  38.82 
 
 
236 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
259 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  38.82 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
201 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  38.82 
 
 
209 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 
305 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  38.82 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  37.8 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1164  methyltransferase domain-containing protein  40.3 
 
 
150 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0250614  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  32.73 
 
 
267 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  30.14 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  25.37 
 
 
264 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  28.66 
 
 
629 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  43.18 
 
 
275 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  36.59 
 
 
226 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  32.18 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
296 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  39.24 
 
 
246 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  29.76 
 
 
264 aa  48.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
224 aa  48.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  24.68 
 
 
213 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.7 
 
 
240 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
337 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  35.37 
 
 
258 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  36.59 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  36.14 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  28.04 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  39 
 
 
262 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  30.77 
 
 
226 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 
254 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  23.56 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  34.21 
 
 
325 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  35.9 
 
 
252 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  40.43 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  23.16 
 
 
237 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4457  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4271  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4108  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4119  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0995588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4494  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4603  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.964338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4455  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.821165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  30.86 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4222  methyltransferase type 11  28 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4508  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0742  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3087  methyltransferase type 11  25.95 
 
 
212 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
252 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2214  23S rRNA methyltransferase A  30.85 
 
 
276 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000260079  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
256 aa  45.1  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
242 aa  45.1  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.41 
 
 
265 aa  44.7  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  36.08 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  25.44 
 
 
240 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  27.64 
 
 
575 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  46.15 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  28.07 
 
 
275 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.66 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  24.26 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>