More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0640 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  100 
 
 
197 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  54.21 
 
 
200 aa  213  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  44.85 
 
 
200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  48.44 
 
 
228 aa  181  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  45.9 
 
 
200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.78 
 
 
203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  40.41 
 
 
217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  39.56 
 
 
220 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  40.72 
 
 
210 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  38.34 
 
 
217 aa  118  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.89 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  41.32 
 
 
209 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  34.39 
 
 
222 aa  111  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  38.36 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
215 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  40.31 
 
 
218 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
212 aa  98.6  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  34.24 
 
 
209 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.42 
 
 
224 aa  85.5  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  45.1 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  37.24 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  36.57 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  38.98 
 
 
400 aa  72.4  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  33.71 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  34.36 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  31.93 
 
 
251 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  33.13 
 
 
423 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  34.34 
 
 
264 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  36.75 
 
 
210 aa  58.2  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
305 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  32.03 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  35.86 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  35 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
442 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
214 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  33.15 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  33.15 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  35.03 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
225 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  33.15 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
348 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  34 
 
 
196 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  21.26 
 
 
215 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  36.44 
 
 
309 aa  55.1  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
442 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12690  hypothetical protein  34.07 
 
 
250 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.09325e-49  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
208 aa  54.7  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  40.86 
 
 
200 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  39.36 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  32 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  34.71 
 
 
319 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
291 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  23.2 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  39.18 
 
 
244 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  35.79 
 
 
263 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  35.58 
 
 
222 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  40.7 
 
 
207 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  35.58 
 
 
267 aa  52  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
197 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.72 
 
 
224 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  28.19 
 
 
312 aa  51.6  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.08 
 
 
263 aa  51.6  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
477 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
196 aa  51.6  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
208 aa  51.2  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
317 aa  51.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  35.42 
 
 
246 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
1106 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  32.2 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  25.16 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  28.87 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
351 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
259 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
242 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  29.08 
 
 
248 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  34.23 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  25.77 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  27.46 
 
 
250 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  31.06 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  27.67 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
252 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
307 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
239 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
239 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  35.16 
 
 
251 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 
226 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
232 aa  48.9  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
239 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
238 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  37 
 
 
240 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.27 
 
 
390 aa  48.9  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1627  methyltransferase type 12  29.88 
 
 
230 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>