More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3026 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  86.6 
 
 		 196 aa  350  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  85.57 
 
 		 196 aa  345  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  59.18 
 
 		 201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  59.36 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  59.36 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  59.36 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  59.36 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  59.36 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  59.36 
 
 		 201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  52.58 
 
 		 202 aa  194  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  53.57 
 
 		 201 aa  184  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  53.06 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  52.55 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  52.04 
 
 		 201 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  52.04 
 
 		 201 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  51.02 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2456  methyltransferase type 11  51.02 
 
 		 204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  42.39 
 
 		 551 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  30.59 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.9 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  30.57 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  29.27 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 575 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  31.08 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  29.25 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  25.86 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  26.97 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  30.41 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  30.22 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  29.21 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  26.19 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  31.25 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  31.25 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  30.81 
 
 		 1287 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  27.95 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  28.81 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  32.59 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  30.38 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  26.75 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  28.25 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  37.86 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  31.36 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  28.86 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.58 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  33 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  37.93 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  35.88 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  27.07 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 348 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  36.07 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  26.05 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  32.61 
 
 		 423 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  32 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.53 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  26.32 
 
 		 390 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 269 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  29.85 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  35.71 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  27.69 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.71 
 
 		 202 aa  52  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>