More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0233 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  78.74 
 
 		 208 aa  349  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  78.26 
 
 		 207 aa  345  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  77.4 
 
 		 208 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  76.24 
 
 		 218 aa  322  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  70.19 
 
 		 208 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  72.41 
 
 		 207 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  70.67 
 
 		 208 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  68.12 
 
 		 213 aa  300  9e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  69.23 
 
 		 211 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  66.67 
 
 		 208 aa  286  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  61.93 
 
 		 210 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  56.04 
 
 		 208 aa  230  9e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  33.82 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  34.01 
 
 		 1287 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  31.79 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  33.85 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 199 aa  72  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  29.61 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  27.37 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  28.95 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  29.14 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  27.18 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  26.97 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  34.38 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  29.69 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  29.69 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  33.07 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  32.03 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  32.67 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  28.16 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.98 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3118  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2974  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  30.69 
 
 		 440 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  28.46 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  29.81 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1147  methyltransferase type 12  31.48 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1564  conserved hypothetical protein, possible methyltransferase  25.89 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  28.72 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  33.59 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  25.5 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  29.81 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  30.94 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.77 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  24.54 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  30.83 
 
 		 315 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.49 
 
 		 390 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.87 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.81 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 269 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  30.33 
 
 		 253 aa  52.4  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  29.27 
 
 		 323 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  33.33 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.43 
 
 		 256 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  28.65 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  28.65 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.66 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  28.65 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  28.78 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  27.37 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.557107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>