More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0925 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  100 
 
 
222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  39.58 
 
 
192 aa  158  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  40.62 
 
 
192 aa  158  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  46.46 
 
 
1287 aa  155  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  41.24 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  39.69 
 
 
192 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  41.71 
 
 
195 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  40.82 
 
 
202 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  36.04 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  36.04 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  36.6 
 
 
201 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  36.14 
 
 
364 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  37.56 
 
 
203 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  40.28 
 
 
199 aa  96.3  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.74 
 
 
200 aa  88.6  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  41.98 
 
 
200 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  33.5 
 
 
195 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  39.44 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  35.39 
 
 
199 aa  85.5  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  37.28 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  36.91 
 
 
197 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  36.08 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  35.46 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  33.66 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  34.51 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
575 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  34.98 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  31.84 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  33.91 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  35.33 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  31.53 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  32.51 
 
 
440 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  33.16 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  33.16 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  33.16 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  32.87 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  33.16 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  32.87 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  33.16 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  35.29 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  33.16 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  34.9 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  35.1 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
551 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  32.98 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  31.11 
 
 
196 aa  72  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  35.62 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  30.05 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  29.51 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  28.49 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.93 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  31.67 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  46.34 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  30.63 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  43.43 
 
 
268 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.88 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  30.66 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.27 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.6 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  30.34 
 
 
390 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  30.26 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  29.7 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  29.7 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0660  methyltransferase type 11  40.57 
 
 
303 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  29.7 
 
 
236 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  29.7 
 
 
236 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
236 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1113  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  29.7 
 
 
236 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  29.7 
 
 
236 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  27.43 
 
 
235 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  23.39 
 
 
208 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  31.15 
 
 
394 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  41.3 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
305 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.11 
 
 
200 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
319 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  34.21 
 
 
267 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  30.21 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  27.44 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4807  Methyltransferase type 12  33.01 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  28.71 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.89 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  25.25 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.89 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.89 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.77 
 
 
434 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
250 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 
239 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.54 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>