More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0660 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0660  methyltransferase type 11  100 
 
 		 303 aa  622  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  59.93 
 
 		 280 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0877  hypothetical protein  25.58 
 
 		 271 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  37.04 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  27.89 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  27.89 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  27.89 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.41 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.45 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  27.89 
 
 		 541 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.29 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.04 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.45 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 248 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.41 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.39 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.91 
 
 		 229 aa  57  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  32.73 
 
 		 541 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.94 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.48 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1966  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000755977  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  36.61 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.73 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  24.67 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.44 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  33.74 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 232 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.56 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.48 
 
 		 232 aa  54.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.91 
 
 		 253 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3607  hypothetical protein  31.03 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.25 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.48 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.56 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3600  hypothetical protein  31.03 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 232 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 241 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  28.03 
 
 		 208 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 243 aa  52.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.14 
 
 		 233 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.32 
 
 		 260 aa  52.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 250 aa  52.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.56 
 
 		 253 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.63 
 
 		 241 aa  52.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  32.61 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.63 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  24.34 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.78 
 
 		 258 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.23 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 199 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.61 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  33.61 
 
 		 414 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.56 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.48 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2180  methyltransferase type 12  32.17 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.69 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.36 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.34 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  31.36 
 
 		 242 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 201 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 199 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.36 
 
 		 236 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.56 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1948  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.78 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  0.0132888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  30.13 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30 
 
 		 253 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 238 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3290  methyltransferase  29.31 
 
 		 239 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.48 
 
 		 253 aa  50.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.73 
 
 		 232 aa  50.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  29.92 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  31.62 
 
 		 239 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  33.06 
 
 		 248 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>