More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2568 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  100 
 
 
199 aa  408  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  78.89 
 
 
201 aa  330  7.000000000000001e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  53.27 
 
 
199 aa  211  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  40.83 
 
 
198 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3396  Methyltransferase type 11  40.24 
 
 
198 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3294  Methyltransferase type 11  37.87 
 
 
198 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.216078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  32.02 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  31.46 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  27.37 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  31.62 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  30.95 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  30.2 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  28.06 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  34.68 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  30.77 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  29.23 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  30 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  30 
 
 
236 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 
198 aa  67.8  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  33.53 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  31.33 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  29.23 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  32.56 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  31.06 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3997  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5451  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  28 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  30.25 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  28.81 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01387  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.47 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01398  hypothetical protein  30.47 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1657  tellurite resistance protein TehB  30.25 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
253 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1511  tellurite resistance protein TehB  30.47 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2230  tellurite resistance protein TehB  30.47 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  30.25 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  42.53 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  31.45 
 
 
219 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  30.25 
 
 
197 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  36.03 
 
 
215 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  38.38 
 
 
207 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  29.41 
 
 
197 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  40.4 
 
 
217 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  42.5 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12690  hypothetical protein  30.9 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.09325e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  30.83 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
216 aa  58.9  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  41.3 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  32.03 
 
 
410 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  35.34 
 
 
197 aa  58.5  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  28.95 
 
 
194 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4948  thiopurine S-methyltransferase  27.39 
 
 
206 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.560333 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  32.2 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  40 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  38.3 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  26.51 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  38.71 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  31.09 
 
 
290 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3410  hypothetical protein  31.97 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.134016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1324  methyltransferase type 11  24.42 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
293 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 
286 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1748  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.93 
 
 
396 aa  55.8  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.829611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3207  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.66 
 
 
390 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3460  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.66 
 
 
390 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.73 
 
 
541 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1461  Methyltransferase type 11  27.57 
 
 
215 aa  55.1  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
291 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
205 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
203 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
205 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
205 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  29.05 
 
 
541 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 
218 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  29.75 
 
 
387 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.64 
 
 
447 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  38 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3080  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.64 
 
 
429 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107319  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  36.27 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  27.68 
 
 
392 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  29.75 
 
 
387 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  28.82 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  29.05 
 
 
541 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>