More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3339 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  100 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  100 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  100 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  55.78 
 
 
214 aa  214  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  50.98 
 
 
206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  52.71 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  50.25 
 
 
226 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  47.57 
 
 
217 aa  190  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  46.53 
 
 
210 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  43.84 
 
 
208 aa  175  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  47.76 
 
 
206 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
208 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  50.24 
 
 
221 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  44.66 
 
 
216 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  48.76 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  45.27 
 
 
227 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  47.32 
 
 
217 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  44.12 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  45.1 
 
 
203 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  38.81 
 
 
396 aa  131  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  44.02 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  40.48 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  46.81 
 
 
189 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  41.12 
 
 
211 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  41.95 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  43.22 
 
 
210 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  49.26 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  43.2 
 
 
197 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  42 
 
 
227 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  42.69 
 
 
253 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  37.81 
 
 
217 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  42.86 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  38.68 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  40 
 
 
196 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  45.33 
 
 
226 aa  95.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  41.3 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  43.92 
 
 
410 aa  89.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  39.52 
 
 
221 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  37.44 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  39.55 
 
 
208 aa  84.7  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  37.76 
 
 
544 aa  84.7  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  40.69 
 
 
204 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  41.1 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  33.51 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  34.47 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  34.15 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  33.16 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  33.17 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  37.89 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  38.53 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  38.58 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  43.27 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  37.21 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
246 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  37.61 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  34.04 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  31.61 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  37.67 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  36.65 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3294  Methyltransferase type 11  43.1 
 
 
198 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.216078  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  39.26 
 
 
200 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
202 aa  61.6  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  34.42 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  33.77 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  45.33 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  33.77 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  26.42 
 
 
277 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
250 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  33.12 
 
 
217 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0492  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.31 
 
 
428 aa  59.3  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  35.78 
 
 
196 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
195 aa  58.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  27.07 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3243  methyltransferase type 12  36.61 
 
 
206 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0787423  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.35 
 
 
305 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  36.27 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 
219 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  30.3 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 
382 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
283 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  52.73 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
149 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  26.84 
 
 
221 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3396  Methyltransferase type 11  47.73 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  37.7 
 
 
241 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  27.88 
 
 
292 aa  56.2  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  30 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
327 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
234 aa  55.5  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  34.78 
 
 
267 aa  55.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>