More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0255 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  100 
 
 		 211 aa  423  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  75.83 
 
 		 211 aa  328  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  50 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  45.1 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  43.87 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  47.32 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  46.04 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  43.84 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  45.67 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  44.55 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  41.35 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  40.1 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  38.42 
 
 		 214 aa  121  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  43.06 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  43.06 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  43.06 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  39.6 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  39.41 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  41 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  37.8 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  37.04 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  41 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  39.61 
 
 		 544 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  41.95 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  36.42 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  40.37 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  40.1 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  40.1 
 
 		 223 aa  104  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  38.73 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 217 aa  101  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  48.8 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  36.88 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  35.75 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  35.23 
 
 		 200 aa  94.7  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  43.45 
 
 		 410 aa  92.8  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  41.48 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  33.97 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  35.81 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  32.07 
 
 		 195 aa  84.7  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  33.49 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  33.04 
 
 		 396 aa  81.3  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  33.96 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  41.07 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  29.34 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  33.73 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  29.76 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  31.67 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  28.92 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  26.71 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  29.48 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  35.07 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  29.71 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  32.3 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  29.79 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  32.1 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  30.36 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  27.81 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  30.25 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  27.11 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  35.07 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  35.85 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  57.89 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  24.71 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  31.36 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  30.9 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  30.34 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  26.6 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  40.43 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  21.89 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  31.48 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  36.75 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  25.95 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  23.12 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  23.27 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5356  hypothetical protein  51.92 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204548  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  22.93 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>