More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5269 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  100 
 
 
219 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4927  Methyltransferase type 12  50 
 
 
218 aa  174  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  0.017224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2087  Methyltransferase type 11  46.97 
 
 
221 aa  158  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.261869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4557  thiopurine S-methyltransferase  38.6 
 
 
229 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  43.22 
 
 
220 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5314  Methyltransferase type 11  38.67 
 
 
225 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0974  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 
225 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0947  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 
225 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3813  methyltransferase type 12  41.4 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2424  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
216 aa  99  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  38.17 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2219  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.419213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  34.67 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  34.9 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  35.17 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  42.31 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  43.64 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  38.56 
 
 
189 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  35.95 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  40.54 
 
 
221 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  39.5 
 
 
253 aa  62  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.12 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  38.68 
 
 
410 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.13 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  30 
 
 
318 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  45.79 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  33.11 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  37.4 
 
 
544 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  42.45 
 
 
227 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  30.3 
 
 
342 aa  58.9  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  36.75 
 
 
211 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  34.27 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3396  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 
198 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  38.13 
 
 
270 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  38.13 
 
 
270 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  38.13 
 
 
270 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.03 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.3 
 
 
238 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.06 
 
 
229 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
199 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.75 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.08 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  41.07 
 
 
232 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.47 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
211 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  33.72 
 
 
214 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
284 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 
252 aa  55.5  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  34.35 
 
 
207 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.52 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.72 
 
 
280 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.75 
 
 
245 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43688  predicted protein  33.13 
 
 
378 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  35.61 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  29.33 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3294  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.216078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  38.74 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  41.44 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.86 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  36 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4856  methyltransferase type 11  40.82 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  26.71 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  34.35 
 
 
257 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  38.39 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  31.52 
 
 
198 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  28.31 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.6 
 
 
232 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3410  hypothetical protein  30.86 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.134016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  32.09 
 
 
196 aa  52.4  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  37.17 
 
 
226 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  41.96 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 
286 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  36.21 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.06 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.12 
 
 
232 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  33.9 
 
 
267 aa  52  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 
197 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  33.33 
 
 
283 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  32.21 
 
 
206 aa  52  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
206 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.07 
 
 
246 aa  51.6  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  29.68 
 
 
283 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  36.63 
 
 
196 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.91 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.87 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  36.73 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.8 
 
 
247 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  31.07 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.03 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>