More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3908 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  100 
 
 
189 aa  368  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  52.97 
 
 
204 aa  157  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  46.52 
 
 
214 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  50.26 
 
 
221 aa  148  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  45.79 
 
 
217 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  44 
 
 
243 aa  134  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  40.11 
 
 
208 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  44.44 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  41.08 
 
 
208 aa  131  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  39.89 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  42.25 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  46.81 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  46.81 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  46.81 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  39.27 
 
 
210 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  39.13 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  47.37 
 
 
221 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  46.3 
 
 
211 aa  118  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  43.46 
 
 
217 aa  118  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  43.58 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  49.6 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  52 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  40.41 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  38.3 
 
 
227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  49.21 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  54.26 
 
 
227 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  50.65 
 
 
215 aa  105  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  53.23 
 
 
217 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  50.79 
 
 
218 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  44.51 
 
 
203 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  39.9 
 
 
210 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  42.33 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  42.69 
 
 
396 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  50.77 
 
 
410 aa  99  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  45.39 
 
 
223 aa  97.8  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  50.4 
 
 
221 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  41.05 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  37.21 
 
 
544 aa  94  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  45.26 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  45.97 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  41.36 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  42.74 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  43.75 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  45.67 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  37.01 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  39.02 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  39.35 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  41.24 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  39.66 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  41.03 
 
 
200 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  33.79 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  34.96 
 
 
198 aa  62.4  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  38.16 
 
 
198 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  38.97 
 
 
243 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3243  methyltransferase type 12  43.14 
 
 
206 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0787423  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
290 aa  62  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  28.15 
 
 
277 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
199 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  30.58 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  37.01 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.92 
 
 
299 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  33.86 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  31.25 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  34.21 
 
 
198 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  34.21 
 
 
198 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  34.21 
 
 
198 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  34.21 
 
 
198 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  36.75 
 
 
286 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  41.23 
 
 
199 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  32.74 
 
 
292 aa  57.8  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  31.86 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  37.07 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  30.88 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  37.8 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0987  tellurite resistance protein TehB  27.63 
 
 
286 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  37 
 
 
207 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  41.35 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  35.29 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  31.4 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  40.96 
 
 
295 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  35.45 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  35 
 
 
216 aa  55.5  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
202 aa  55.5  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  32.11 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  34.71 
 
 
209 aa  55.1  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  37.07 
 
 
200 aa  55.1  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  27.91 
 
 
259 aa  55.1  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  34.21 
 
 
212 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  40.96 
 
 
296 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  33.94 
 
 
233 aa  54.7  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  32.11 
 
 
197 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  40.96 
 
 
296 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  32.11 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 
286 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  32.59 
 
 
242 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>