164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0378 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  100 
 
 
213 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  74.13 
 
 
207 aa  295  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  74.5 
 
 
207 aa  293  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  70.44 
 
 
245 aa  279  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  66.83 
 
 
208 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  72.63 
 
 
261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  72.63 
 
 
256 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  72.63 
 
 
256 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  72.63 
 
 
261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  72.54 
 
 
267 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2116  thiopurine S-methyltransferase  66.35 
 
 
208 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2728  thiopurine S-methyltransferase  66.35 
 
 
208 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  72.54 
 
 
264 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0672  putative thiopurine S-methyltransferase  72.54 
 
 
267 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2779  thiopurine S-methyltransferase  64.42 
 
 
208 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  65.71 
 
 
210 aa  257  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  62.98 
 
 
208 aa  247  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2646  thiopurine S-methyltransferase  64.9 
 
 
208 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  58.82 
 
 
209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0337  thiopurine S-methyltransferase  58.33 
 
 
209 aa  218  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  56.37 
 
 
209 aa  211  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  51.76 
 
 
207 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3675  thiopurine S-methyltransferase  54.92 
 
 
201 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000397  SAM-dependent methyltransferase  40.64 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00890  hypothetical protein  31.77 
 
 
191 aa  102  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  33.5 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  32.55 
 
 
216 aa  92  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2081  thiopurine S-methyltransferase  32.83 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  0.891479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3410  hypothetical protein  34.73 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.134016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  35.58 
 
 
198 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  32.34 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  30.41 
 
 
199 aa  82  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4948  thiopurine S-methyltransferase  34.34 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.560333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1335  thiopurine S-methyltransferase  32.93 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2332  thiopurine S-methyltransferase  31.76 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742383  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1421  thiopurine S-methyltransferase  31.71 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30453  predicted protein  29.26 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  30.29 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  36.55 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2525  thiopurine S-methyltransferase  31.46 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186445  normal  0.445106 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0849  thiopurine S-methyltransferase  28.57 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000750886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3985  thiopurine S-methyltransferase  27.22 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02114  thiopurine S-methyltransferase  30.64 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1758  thiopurine S-methyltransferase  25.95 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3617  thiopurine S-methyltransferase  25.62 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1445  thiopurine S-methyltransferase  28.32 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0413435  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1777  thiopurine s-methyltransferase  26.6 
 
 
220 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0541  thiopurine S-methyltransferase  26.57 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3784  thiopurine S-methyltransferase  24.59 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1479  thiopurine S-methyltransferase  28.16 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.193618  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06094  thiol methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13570)  25.64 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0045541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0581  thiopurine S-methyltransferase  25.14 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.904773 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0580  thiopurine S-methyltransferase  26.09 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.947193  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3727  thiopurine S-methyltransferase  24.59 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15380  Thiopurine S-methyltransferase  27.57 
 
 
218 aa  58.9  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417119  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0541  thiopurine S-methyltransferase  24.59 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34805  predicted protein  25.23 
 
 
252 aa  58.5  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3449  thiopurine S-methyltransferase  24.59 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3845  thiopurine S-methyltransferase  27.17 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0510882  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1814  thiopurine S-methyltransferase  27.43 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0216423  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1365  thiopurine S-methyltransferase  25.29 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  26.51 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1870  thiopurine S-methyltransferase  26.59 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.629149  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3910  thiopurine S-methyltransferase  24.59 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2259  thiopurine S-methyltransferase  27.59 
 
 
220 aa  55.5  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.498891  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  35.97 
 
 
410 aa  55.5  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3498  thiopurine S-methyltransferase  24.21 
 
 
219 aa  55.1  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3261  thiopurine S-methyltransferase  27.57 
 
 
218 aa  55.1  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154958  hitchhiker  0.00386199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4927  Methyltransferase type 12  28.49 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  0.017224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0974  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0947  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2645  hypothetical protein  26.49 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140022  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  26.44 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  26.44 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0794  thiopurine S-methyltransferase  25.81 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000172804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  25.29 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  24.35 
 
 
199 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  28.31 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2087  Methyltransferase type 11  26.74 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.261869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4010  thiopurine S-methyltransferase  27.19 
 
 
226 aa  52  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000530597  unclonable  0.000000000128309 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2608  hypothetical protein  25.17 
 
 
209 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000306401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3296  thiopurine S-methyltransferase  25.68 
 
 
218 aa  52  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0543  thiopurine S-methyltransferase  26.29 
 
 
218 aa  51.6  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0425379  hitchhiker  0.00996251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0588  thiopurine S-methyltransferase  23.19 
 
 
219 aa  51.6  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00909445  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0582  thiopurine S-methyltransferase  24.87 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2413  hypothetical protein  25.17 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00295431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2368  methyltransferase  25.17 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2590  hypothetical protein  25.17 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  29.86 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2564  hypothetical protein  24.32 
 
 
209 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2333  methyltransferase  24.5 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0767046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  26.9 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  27.89 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2762  hypothetical protein  25.83 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2608  hypothetical protein  25.17 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3096  thiopurine S-methyltransferase family protein  23.28 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  34.07 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>