98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1445 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1445  thiopurine S-methyltransferase  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0413435  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3845  thiopurine S-methyltransferase  81.02 
 
 
216 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0510882  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1870  thiopurine S-methyltransferase  80.09 
 
 
216 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.629149  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1479  thiopurine S-methyltransferase  74.88 
 
 
215 aa  324  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.193618  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15380  Thiopurine S-methyltransferase  61.75 
 
 
218 aa  261  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2525  thiopurine S-methyltransferase  58.53 
 
 
219 aa  260  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186445  normal  0.445106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3985  thiopurine S-methyltransferase  58.33 
 
 
217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1777  thiopurine s-methyltransferase  53.67 
 
 
220 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3617  thiopurine S-methyltransferase  49.77 
 
 
220 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27460  thiopurine S-methyltransferase  53 
 
 
218 aa  218  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00890318  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2323  thiopurine S-methyltransferase  52.53 
 
 
218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2259  thiopurine S-methyltransferase  45.33 
 
 
220 aa  193  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.498891  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0588  thiopurine S-methyltransferase  42.86 
 
 
219 aa  192  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00909445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3498  thiopurine S-methyltransferase  44.7 
 
 
219 aa  190  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3261  thiopurine S-methyltransferase  43.78 
 
 
218 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154958  hitchhiker  0.00386199 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4153  thiopurine S-methyltransferase  45.7 
 
 
223 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0453346  normal  0.132491 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1758  thiopurine S-methyltransferase  49.14 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3784  thiopurine S-methyltransferase  42.86 
 
 
218 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0543  thiopurine S-methyltransferase  44.95 
 
 
218 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0425379  hitchhiker  0.00996251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3727  thiopurine S-methyltransferase  42.86 
 
 
218 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0541  thiopurine S-methyltransferase  42.86 
 
 
218 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3055  thiopurine S-methyltransferase  42.93 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0581  thiopurine S-methyltransferase  42.4 
 
 
218 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.904773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4010  thiopurine S-methyltransferase  41.96 
 
 
226 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000530597  unclonable  0.000000000128309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3910  thiopurine S-methyltransferase  42.86 
 
 
218 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0541  thiopurine S-methyltransferase  42.4 
 
 
218 aa  177  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3449  thiopurine S-methyltransferase  42.4 
 
 
218 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0794  thiopurine S-methyltransferase  42.52 
 
 
222 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000172804  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0580  thiopurine S-methyltransferase  41.94 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.947193  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  44.81 
 
 
226 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1814  thiopurine S-methyltransferase  42.2 
 
 
213 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0216423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0582  thiopurine S-methyltransferase  43.32 
 
 
218 aa  165  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3296  thiopurine S-methyltransferase  41.47 
 
 
218 aa  165  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02114  thiopurine S-methyltransferase  43.4 
 
 
216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2244  thiopurine S-methyltransferase  41.84 
 
 
219 aa  162  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2332  thiopurine S-methyltransferase  45.19 
 
 
218 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742383  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0849  thiopurine S-methyltransferase  43.69 
 
 
218 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000750886  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2726  thiopurine S-methyltransferase  47.73 
 
 
213 aa  158  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3096  thiopurine S-methyltransferase family protein  41.67 
 
 
212 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0514  thiopurine S-methyltransferase  41.98 
 
 
221 aa  154  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.795529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3438  thiopurine S-methyltransferase  43.43 
 
 
213 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  40.94 
 
 
221 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  40.94 
 
 
221 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02272  thiopurine S-methyltransferase family protein  38.14 
 
 
217 aa  138  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0515  thiopurine S-methyltransferase  41.81 
 
 
219 aa  134  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.766215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1365  thiopurine S-methyltransferase  38.97 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233426 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0288  thiopurine S-methyltransferase  38.89 
 
 
230 aa  132  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2473  Thiopurine S-methyltransferase  38.98 
 
 
217 aa  128  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.465624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6497  Thiopurine S-methyltransferase  36.32 
 
 
228 aa  124  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0320896  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1524  thiopurine S-methyltransferase  34.54 
 
 
219 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1333  thiopurine S-methyltransferase  33.33 
 
 
230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3057  thiopurine S-methyltransferase  36.16 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2144  Thiopurine S-methyltransferase  39.13 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00106923  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  29.15 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.49 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  29.31 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  29.55 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  28.32 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  29.31 
 
 
207 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.49 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.49 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.49 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  28.49 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  27.91 
 
 
267 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  30.18 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  27.91 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0672  putative thiopurine S-methyltransferase  29.07 
 
 
267 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  30.46 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  27.01 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  29.07 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1335  thiopurine S-methyltransferase  30.49 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2779  thiopurine S-methyltransferase  28.49 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00890  hypothetical protein  26.94 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  25 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0337  thiopurine S-methyltransferase  26.97 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3675  thiopurine S-methyltransferase  29 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  29.07 
 
 
208 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2728  thiopurine S-methyltransferase  29.07 
 
 
208 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  28.49 
 
 
210 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30453  predicted protein  27.09 
 
 
237 aa  52  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2116  thiopurine S-methyltransferase  29.07 
 
 
208 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  25.12 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  25.12 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  25.12 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  25.12 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  25.12 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  24.64 
 
 
236 aa  48.5  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  27.07 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  26.14 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  24.34 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4948  thiopurine S-methyltransferase  26.47 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.560333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3410  hypothetical protein  28.65 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.134016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1421  thiopurine S-methyltransferase  26.01 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  29.36 
 
 
236 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2646  thiopurine S-methyltransferase  29.85 
 
 
208 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2081  thiopurine S-methyltransferase  27.37 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  0.891479 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
243 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>