152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1421 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1421  thiopurine S-methyltransferase  100 
 
 		 203 aa  420  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4948  thiopurine S-methyltransferase  77.34 
 
 		 206 aa  328  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527262  normal  0.560333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3410  hypothetical protein  57.35 
 
 		 203 aa  232  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.134016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  43.5 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  45.92 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1335  thiopurine S-methyltransferase  39.2 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.249903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  36.84 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0337  thiopurine S-methyltransferase  31.93 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0352  thiopurine S-methyltransferase  31.93 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.675368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00890  hypothetical protein  28.24 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  36.5 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3675  thiopurine S-methyltransferase  29.33 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0557  thiopurine S-methyltransferase family protein  34.13 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  31.71 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05270  conserved hypothetical protein  28.65 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  31.33 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6055  thiopurine S-methyltransferase  32.34 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0190  thiopurine S-methyltransferase family protein  35.12 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2755  thiopurine S-methyltransferase family protein  35.12 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.712624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2323  thiopurine S-methyltransferase family protein  35.12 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2403  thiopurine S-methyltransferase family protein  35.12 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  32.59 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0849  thiopurine S-methyltransferase family protein  34.52 
 
 		 267 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0988064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0688  putative thiopurine S-methyltransferase  34.52 
 
 		 264 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0571  thiopurine S-methyltransferase  33.77 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2755  thiopurine S-methyltransferase  30.95 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0701437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2081  thiopurine S-methyltransferase  32.86 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  0.891479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4046  hypothetical protein  34.94 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.877488 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0672  putative thiopurine S-methyltransferase  34.32 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000397  SAM-dependent methyltransferase  27.61 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2116  thiopurine S-methyltransferase  31.55 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2728  thiopurine S-methyltransferase  31.55 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236769  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2779  thiopurine S-methyltransferase  30.72 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0653  thiopurine S-methyltransferase  33.14 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.696799  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2646  thiopurine S-methyltransferase  31.14 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178903 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06094  thiol methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13570)  28.37 
 
 		 283 aa  62  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0045541 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30453  predicted protein  33.33 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  22.96 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  22.22 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  22.96 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  30.33 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  22.22 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  22.22 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  22.22 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  29.94 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  30.23 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  22.96 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  22.14 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  21.48 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  30.77 
 
 		 541 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  30.77 
 
 		 541 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  30.77 
 
 		 541 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  30.77 
 
 		 541 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  30.77 
 
 		 541 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13730  hypothetical protein  27.85 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.735974 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  30.08 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34805  predicted protein  25.55 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  33.33 
 
 		 460 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1324  methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0288  thiopurine S-methyltransferase  32.39 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1365  thiopurine S-methyltransferase  21.62 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233426 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2244  thiopurine S-methyltransferase  28.42 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  26 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1445  thiopurine S-methyltransferase  26.59 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0413435  normal  0.359474 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2155  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  34.02 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2068  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  34.02 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  29.07 
 
 		 241 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0794  thiopurine S-methyltransferase  25 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000172804  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  28.82 
 
 		 410 aa  48.5  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  40.28 
 
 		 309 aa  48.5  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 250 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2549  adenylylsulfate kinase  27.07 
 
 		 388 aa  48.5  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.064569 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2747  thiopurine S-methyltransferase  21.5 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2892  thiopurine S-methyltransferase  21.5 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003701  thiopurine S-methyltransferase  24.86 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.994639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  32.41 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1201  Methyltransferase type 12  24.7 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02114  thiopurine S-methyltransferase  24.31 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  27.21 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  22.7 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  25.2 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  22.7 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  19.26 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 243 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0132  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltrans ferase  31.47 
 
 		 392 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1333  thiopurine S-methyltransferase  28.05 
 
 		 230 aa  45.1  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02620  L-isoaspartate protein carboxylmethyltransferase  35.05 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>