More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3418 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  100 
 
 		 460 aa  908    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  57.42 
 
 		 465 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  57.42 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.88 
 
 		 453 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  52.99 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.34 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  56.12 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  54.32 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  53.13 
 
 		 493 aa  438  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  49.22 
 
 		 450 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  47.85 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  49.09 
 
 		 450 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  48.97 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  48.11 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  49.89 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  48.51 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  49.56 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  48.51 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  49 
 
 		 448 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.97 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  50.78 
 
 		 454 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.52 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.98 
 
 		 447 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  46.7 
 
 		 440 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  47.26 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  48.31 
 
 		 448 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.26 
 
 		 426 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  43.66 
 
 		 443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  43.72 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  44.16 
 
 		 419 aa  257  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.05 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  40.47 
 
 		 410 aa  249  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  46.39 
 
 		 438 aa  246  8e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  41.18 
 
 		 437 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.55 
 
 		 422 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.46 
 
 		 535 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.52 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  32.44 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  38.71 
 
 		 424 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.36 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.8 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  34.5 
 
 		 427 aa  209  8e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.65 
 
 		 427 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  33.04 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  31.93 
 
 		 429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  32.02 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  31.71 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  33.33 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  31.4 
 
 		 428 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  31.63 
 
 		 427 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  32.24 
 
 		 455 aa  196  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  31.71 
 
 		 429 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  32.96 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  34.63 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  34.63 
 
 		 429 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  34.39 
 
 		 429 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  34.39 
 
 		 429 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  34.18 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  31.84 
 
 		 452 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  33.9 
 
 		 429 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  33.33 
 
 		 429 aa  190  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  31.03 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  34.52 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  33.41 
 
 		 429 aa  189  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  32 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  30.6 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  33.41 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  30.6 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  33.17 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  33.17 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  33.41 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  33.17 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  33.17 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  33.17 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  30.6 
 
 		 428 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  30.36 
 
 		 428 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  32.31 
 
 		 429 aa  186  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  30.53 
 
 		 429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  31.52 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.63 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  33.75 
 
 		 437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  32.93 
 
 		 429 aa  183  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  34.35 
 
 		 448 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  32.12 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  34.38 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  31.89 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  32.03 
 
 		 443 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  33.11 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  32.8 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  32.46 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  33.18 
 
 		 451 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.69 
 
 		 449 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  32.71 
 
 		 451 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  36.12 
 
 		 418 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3405  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.14 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  33.18 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  32.62 
 
 		 453 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3562  sun protein  36.26 
 
 		 457 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  30.6 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  32.48 
 
 		 446 aa  172  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>