More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0966 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
277 aa  577  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  34.18 
 
 
204 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  33.56 
 
 
190 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  30.43 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  27.93 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  28.76 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  28.76 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  28.76 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  53.03 
 
 
380 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  30.99 
 
 
189 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  27.41 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  29.41 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  25.38 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  56.67 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  56.67 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  56.67 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  28.29 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  56.67 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  56.67 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  36.05 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  27.37 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  56.67 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  27.37 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  27.07 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  56.67 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  26.26 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  55 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  26.29 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  34.41 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  33.62 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  28.26 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 
361 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  35.71 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  31.91 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  34.52 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  34.52 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  34.52 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  28.85 
 
 
213 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  34.52 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  24.29 
 
 
190 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0145  thiopurine S-methyltransferase  26.32 
 
 
210 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285436  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  34.52 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  34.52 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  34.52 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  45.33 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  51.61 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  24.48 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  32.37 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  26.82 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  29.5 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  44.59 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  32.06 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  26.53 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  27.33 
 
 
197 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  27.33 
 
 
197 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  28.36 
 
 
149 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  25.69 
 
 
204 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  27.33 
 
 
197 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  27.01 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  33.73 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  30.99 
 
 
200 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  48.33 
 
 
145 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  30.99 
 
 
200 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  25.97 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  51.67 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 
380 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  28.39 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  31.3 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  33.93 
 
 
197 aa  63.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5314  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
225 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  33.33 
 
 
223 aa  62.8  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2162  hypothetical protein  26.37 
 
 
200 aa  62.4  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0386731 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  33.33 
 
 
410 aa  62.4  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
195 aa  62.4  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  51.72 
 
 
364 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  25.12 
 
 
220 aa  62  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  26.89 
 
 
201 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1657  tellurite resistance protein TehB  26.74 
 
 
197 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  29.08 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
202 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  23.84 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  55.77 
 
 
197 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  29.2 
 
 
217 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  26.28 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  27.21 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  30.97 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
227 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  28.3 
 
 
211 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>