211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0145 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0145  thiopurine S-methyltransferase  100 
 
 		 210 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  36.79 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  25.49 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  34.65 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  39.33 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  33.61 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  36.59 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  33.96 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  40.28 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 243 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  32.04 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  28.21 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  32.35 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.49 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.49 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.11 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  32.11 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  26.34 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  33.65 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  31.88 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2173  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 267 aa  48.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 1759 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 246 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  31.11 
 
 		 183 aa  48.1  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  41.79 
 
 		 275 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 560 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.91 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  33.9 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  41.18 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.72 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  61.76 
 
 		 247 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 255 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  28.49 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  31.67 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.07 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 174 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 337 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  31.52 
 
 		 175 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  34.02 
 
 		 262 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.18 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  24.14 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  33.98 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  27.69 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 268 aa  45.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.33 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 260 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  35.23 
 
 		 265 aa  45.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  38.46 
 
 		 238 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.49 
 
 		 288 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 174 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1052  Methyltransferase type 12  26.57 
 
 		 265 aa  45.1  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.48 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.07 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1672  Methyltransferase type 12  33.8 
 
 		 265 aa  45.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  27.93 
 
 		 253 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2045  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 267 aa  45.1  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000233397  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 253 aa  45.1  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.79 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  32.04 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  24.76 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1085 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  36.11 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  28.26 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  34.62 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  37.31 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  22.54 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  31.76 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  34.18 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  34.88 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.1 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 341 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  35.96 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  27.62 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  52.63 
 
 		 296 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  22.54 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>