259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2457 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
380 aa  770    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  45.76 
 
 
197 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  72.31 
 
 
459 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  70.37 
 
 
247 aa  92.8  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  40.28 
 
 
146 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  45.45 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  43.04 
 
 
107 aa  69.3  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  36.11 
 
 
142 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  41.1 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 
262 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 
262 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 
262 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 
277 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  45.16 
 
 
197 aa  63.9  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  38.37 
 
 
196 aa  63.5  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  37.78 
 
 
273 aa  63.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 
205 aa  63.2  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  42.86 
 
 
149 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 
268 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
134 aa  62.4  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  52.63 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  42.03 
 
 
92 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  42.03 
 
 
149 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  41.43 
 
 
149 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 
149 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
192 aa  61.6  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 
185 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  43.75 
 
 
189 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  50.91 
 
 
362 aa  61.2  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
261 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 
189 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  42.03 
 
 
149 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
189 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 
176 aa  60.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
327 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 
142 aa  60.8  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  40.3 
 
 
143 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  46.88 
 
 
293 aa  59.7  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  37.65 
 
 
322 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  38.67 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  40.32 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  32.32 
 
 
208 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  40.32 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  40.32 
 
 
374 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  40.32 
 
 
374 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  40.32 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  40.32 
 
 
374 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  40.32 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  37.65 
 
 
194 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 
374 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  47.22 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  38.03 
 
 
186 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 
276 aa  57.4  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
163 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
395 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
242 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  38.71 
 
 
374 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 
118 aa  56.6  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 
368 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  39.73 
 
 
216 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  39.73 
 
 
216 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  41.67 
 
 
243 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  45 
 
 
240 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 
206 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
141 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  45 
 
 
240 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0978  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
126 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  42.65 
 
 
216 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
183 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0860  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
126 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  39.71 
 
 
200 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  34.25 
 
 
229 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  28.74 
 
 
108 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 
139 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  34.25 
 
 
229 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  46.88 
 
 
144 aa  54.7  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  28.74 
 
 
108 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
178 aa  53.9  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 
312 aa  53.5  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  44.64 
 
 
272 aa  53.1  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
189 aa  53.5  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
115 aa  53.1  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  38.33 
 
 
338 aa  53.1  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 
123 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 
212 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  48.08 
 
 
436 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  40 
 
 
348 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  41.79 
 
 
327 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  35 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.82 
 
 
114 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  33.82 
 
 
114 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
380 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 
118 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  36.25 
 
 
149 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
203 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 
229 aa  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>