264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1286 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
197 aa  403  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  47.94 
 
 
198 aa  204  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  46.32 
 
 
200 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  33.58 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  51.9 
 
 
163 aa  79  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  53.52 
 
 
276 aa  72  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  39.33 
 
 
361 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  55.77 
 
 
277 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 
364 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 
161 aa  58.5  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  36.76 
 
 
374 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  36.76 
 
 
374 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  36.76 
 
 
374 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  36.76 
 
 
374 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  31.19 
 
 
348 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  38.46 
 
 
374 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  38.46 
 
 
374 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  47.62 
 
 
369 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  38.46 
 
 
374 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  40.32 
 
 
146 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  40 
 
 
374 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
374 aa  55.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  44.78 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 
368 aa  55.1  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  41.79 
 
 
256 aa  55.1  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  44.83 
 
 
149 aa  55.1  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 
370 aa  54.7  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 
513 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  44.29 
 
 
436 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  37.29 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
380 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 
266 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  32.04 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  36.07 
 
 
142 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 
135 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  40.32 
 
 
328 aa  51.2  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 
113 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  35.82 
 
 
145 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  43.33 
 
 
200 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 
185 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  26.26 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
334 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  37 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  38.98 
 
 
296 aa  49.3  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
183 aa  49.7  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 
142 aa  48.9  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  39.34 
 
 
252 aa  49.3  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 
273 aa  48.9  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  42.31 
 
 
149 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2467  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 
109 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 
149 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  40.38 
 
 
149 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 
268 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  42.59 
 
 
262 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  38.89 
 
 
149 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 
364 aa  48.5  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 
262 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0533  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 
90 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
137 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  40.38 
 
 
92 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  27.27 
 
 
213 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  27.27 
 
 
285 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 
262 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1020  XRE family transcriptional regulator  27.1 
 
 
149 aa  48.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.638142  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  27.27 
 
 
285 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  27.27 
 
 
285 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  40.38 
 
 
149 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
132 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 
131 aa  48.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 
231 aa  48.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  34.74 
 
 
346 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 
144 aa  48.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 
262 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  27.27 
 
 
285 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  46.43 
 
 
95 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5479  putative transcriptional regulator PlcR  27.27 
 
 
285 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000111873  hitchhiker  1.75075e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  39.68 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  27.27 
 
 
285 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 
69 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  50.98 
 
 
503 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
69 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
68 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
825 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
69 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  39.13 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  30 
 
 
327 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  27.27 
 
 
285 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  39.34 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
125 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 
87 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  41.82 
 
 
459 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
73 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 
192 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 
142 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 
139 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.17746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>