52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3627 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 87 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4414  transcriptional regulator, XRE family  55.38 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.514306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4734  XRE family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3774  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0502189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1799  transcriptional regulator, XRE family  43.04 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 239 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  53.7 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  40.91 
 
 		 610 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0746  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 214 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5367  transcriptional regulator, XRE family  43.18 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.216549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2500  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3947  transcriptional regulator, XRE family  51.11 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0928  hypothetical protein  35.19 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.729389  normal  0.315243 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  27.71 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4058  DNA-binding protein  36.96 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.326996  normal  0.47831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3986  DNA-binding protein  36.96 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0317  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0550269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1020  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  38 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  45.24 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4174  DNA-binding protein  36.96 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4004  DNA-binding protein  36.96 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  43.18 
 
 		 369 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  48.78 
 
 		 508 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1065  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  35.62 
 
 		 348 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  34.62 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  35.62 
 
 		 210 aa  41.6  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 118 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7348  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159778  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  40.48 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  39.02 
 
 		 374 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0387  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000537599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4437  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672925  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  37.5 
 
 		 436 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2677  helix-turn-helix domain-containing protein  32.61 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4109  DNA-binding protein  34.78 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2974  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0125  hypothetical protein  34.78 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3694  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.516749  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0975  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 147 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>