60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0746 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0746  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 64 aa  134  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2500  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 69 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_264  hypothetical protein  56 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0387  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000537599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4734  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3627  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  47.92 
 
 		 610 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3774  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0502189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  46.51 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4414  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.514306 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  46.51 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1799  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  44.19 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1676  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3947  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5367  transcriptional regulator, XRE family  52.78 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.216549 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  43.9 
 
 		 233 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  46.34 
 
 		 436 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  43.9 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  43.9 
 
 		 233 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7348  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159778  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1065  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  0.845779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1541  transcriptional regulator, XRE family  43.18 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0274839  hitchhiker  0.00170157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  48.84 
 
 		 200 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1445  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  40.91 
 
 		 342 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  45.24 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2731  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  42.11 
 
 		 229 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4437  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2653  XRE family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0271139  normal  0.0108721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1020  transcriptional regulator, XRE family  41.46 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3446  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  44.19 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1912  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  42.86 
 
 		 347 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0317  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0550269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  48.72 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 74 aa  40  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 74 aa  40  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 178 aa  40  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  44.74 
 
 		 229 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5658  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 95 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  45.24 
 
 		 106 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>