More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3134 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  100 
 
 		 80 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  51.43 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  46.77 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 74 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  46.67 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  45 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  43.55 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  43.75 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  41.98 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0415  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  42.65 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1629  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0731  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  42.42 
 
 		 315 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  38.24 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  38.24 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.31 
 
 		 323 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3387  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  40.98 
 
 		 68 aa  52  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  36.47 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4018  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  43.55 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  36.47 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1019  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  43.28 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0075  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.36 
 
 		 304 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4410  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4271  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  43.94 
 
 		 255 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 104 aa  50.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 73 aa  50.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 83 aa  50.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 81 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 81 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  38.1 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  43.94 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3658  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.77 
 
 		 318 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3420  transcriptional regulator, XRE family protein  41.94 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 72 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 90 aa  50.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 75 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  40.85 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1891  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3457  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5389  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.33 
 
 		 316 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>