253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2326 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  176  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  96.39 
 
 
84 aa  164  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  53.52 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  53.33 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  46.67 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2009  DNA-binding protein  42.62 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 
81 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  44.93 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
81 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 
104 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  43.55 
 
 
69 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
81 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
81 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  43.33 
 
 
70 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
74 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 
73 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 
73 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 
73 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  45 
 
 
69 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
390 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1957  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
89 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
78 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
85 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  38.24 
 
 
80 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1141  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.519816  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
93 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
75 aa  52.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  41.54 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  46.67 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  40 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 
69 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  36.51 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 
76 aa  50.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
83 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 
83 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
81 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
74 aa  50.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  41.1 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  41.67 
 
 
72 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40 
 
 
72 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1891  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 
68 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  39.44 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3457  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 
68 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3538  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.902272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
83 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  39.68 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 
230 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4018  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1959  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.127837  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  37.29 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  28.99 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 
333 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
183 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 
333 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  30.65 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  30.65 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
90 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2016  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 
93 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 
91 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  37.97 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>