252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6923 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 81 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  98.77 
 
 		 93 aa  157  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  61.73 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  61.73 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  64.2 
 
 		 81 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  62.96 
 
 		 81 aa  96.7  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  54.32 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2012  DNA-binding protein  62.12 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2009  DNA-binding protein  56.92 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  48.57 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  59.18 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  48.57 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  54.1 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  49.18 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  49.18 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  47.06 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  47.54 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  56 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  47.69 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  37.88 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  37.88 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  51.67 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  48.28 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  43.75 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4018  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  45.16 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0687  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0236581  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 390 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  44.12 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  44.44 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3420  transcriptional regulator, XRE family protein  45 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3457  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1891  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3463  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4410  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4271  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  45.16 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  41.94 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3268  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  38.1 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  41.94 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  46.94 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3538  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.902272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>