More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1907 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 94 aa  186  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  98.94 
 
 		 94 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  98.94 
 
 		 94 aa  184  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  98.94 
 
 		 94 aa  184  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  98.94 
 
 		 94 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  98.94 
 
 		 94 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  98.94 
 
 		 94 aa  184  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  75.34 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  73.61 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  74.63 
 
 		 73 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  74.63 
 
 		 73 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  74.63 
 
 		 73 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  72.88 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  67.21 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  58.21 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  50 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  45.71 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  38.81 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  39.39 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  41.27 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  42.19 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  41.79 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  40.26 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 74 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 210 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 71 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 71 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 185 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 256 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.62 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.94 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  35.82 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  38.81 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 390 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 207 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3387  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 224 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 195 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  39.68 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 255 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.06 
 
 		 129 aa  50.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>