257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0684 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 101 aa  211  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0687  XRE family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0236581  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 390 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  50 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  39.39 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  40.98 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3387  transcriptional regulator, XRE family  38.2 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  43.33 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  43.33 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  38.03 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  40.91 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06215  hypothetical protein  41.27 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2542  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  37.31 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  37.31 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 71 aa  48.1  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 219 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  35.94 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.43 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  35.82 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.7 
 
 		 323 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>