More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3316 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 60 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  50 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  45.28 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.37 
 
 		 481 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4938  transcriptional regulator, DNA-binding protein  44.07 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4742  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0122495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2542  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 244 aa  47.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5107  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5498  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4953  transcriptional regulator, DNA-binding protein  42.37 
 
 		 63 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  35.09 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  48.28 
 
 		 216 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0285  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.17528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4177  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 231 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  36.21 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3458  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  40 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.86 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.96581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3464  hypothetical protein  38.78 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 371 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 490 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5575  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  40.35 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3124  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1681  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.527285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 300 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  40.68 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3072  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0716873 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0453  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  35.09 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  44.23 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 490 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 272 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  40 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 272 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0936  helix-turn-helix domain-containing protein  40.35 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  43.4 
 
 		 194 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5730  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 239 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  38.6 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 210 aa  44.3  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4684  hypothetical protein  36.21 
 
 		 224 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1891  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00988673  normal  0.0163804 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 206 aa  44.3  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 252 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>