More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0070 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 67 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  98.51 
 
 		 67 aa  134  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  97.01 
 
 		 67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  97.01 
 
 		 67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  97.01 
 
 		 67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  97.01 
 
 		 67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  97.01 
 
 		 67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  97.01 
 
 		 67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  97.01 
 
 		 67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  97.01 
 
 		 67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  72.73 
 
 		 73 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  71.21 
 
 		 73 aa  103  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0070  XRE family transcriptional regulator  94.23 
 
 		 52 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 175 aa  57  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 252 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  40.32 
 
 		 200 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 504 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1143 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  39.34 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 212 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  38.71 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 281 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 		 255 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 387 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 505 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 255 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 195 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  35.48 
 
 		 302 aa  47.4  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 256 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  37.1 
 
 		 312 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 503 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  37.1 
 
 		 308 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0622  transcriptional regulator, putative  36.51 
 
 		 303 aa  45.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.436499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2432  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020915 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 495 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 374 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 202 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  34.92 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0068  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  33.87 
 
 		 303 aa  45.1  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  35.38 
 
 		 513 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 224 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0045  PbsX family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  35.48 
 
 		 301 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  37.7 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  37.7 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  33.9 
 
 		 215 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 196 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  40 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 195 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  37.7 
 
 		 209 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  35.48 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 180 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>