More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0278 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
128 aa  251  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 
321 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  33.03 
 
 
206 aa  60.8  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  40.58 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  40.58 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
327 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  28.7 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  31.75 
 
 
225 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  35.05 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  39.13 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  35.65 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  40.98 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.82 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  37.8 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  31.82 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
281 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  46.15 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  37.66 
 
 
347 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  30.08 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  36.63 
 
 
233 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  36.63 
 
 
233 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
175 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  36.63 
 
 
233 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  35.96 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
205 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  41.67 
 
 
263 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 
300 aa  53.9  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  35.24 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
359 aa  52.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
231 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  30 
 
 
117 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3926  transcriptional regulator, XRE family  37.21 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  42.62 
 
 
229 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 
504 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  30.48 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  32.71 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
118 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4971  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  40.58 
 
 
210 aa  52  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 
395 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
115 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  36.79 
 
 
131 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 
137 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  39.34 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  41.67 
 
 
229 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
105 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  40.24 
 
 
175 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  39.34 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  41.67 
 
 
229 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  30.97 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  32.95 
 
 
206 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  41.54 
 
 
495 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  37.1 
 
 
205 aa  50.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 
194 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  39.13 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  34.78 
 
 
342 aa  50.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
115 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  40.32 
 
 
209 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  37.7 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  37.7 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  38.57 
 
 
194 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  41.67 
 
 
259 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 
200 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  30.84 
 
 
240 aa  49.7  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 
206 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  46.88 
 
 
217 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  39.66 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  39.66 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  31 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  31 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>