96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2113 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  35.51 
 
 		 321 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  31.07 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  32.04 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 152 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  37.14 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  36.25 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  36.25 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  36.25 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  36.25 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  36.25 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  36.25 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  36.25 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  36.25 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  32.99 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 231 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 359 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  40 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  28.28 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 171 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1708  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 231 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0192115  normal  0.600335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 		 262 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  36.67 
 
 		 262 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  29.76 
 
 		 518 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  32.04 
 
 		 293 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  29.27 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  36.67 
 
 		 262 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  31.18 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0355  hypothetical protein  38.24 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  26.21 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 262 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  26.21 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  34.62 
 
 		 301 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1063  transcriptional regulator, putative  30.69 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.150252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1170  DNA-binding protein  32.67 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234242  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  28.12 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  28.89 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  32.2 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.21 
 
 		 481 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 500 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  27.78 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  27.78 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 528 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5811  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10438  transcriptional regulator, putative  28.79 
 
 		 147 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 114 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  32.88 
 
 		 181 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 281 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1144  helix-turn-helix domain-containing protein  36.59 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  29.76 
 
 		 496 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 178 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2803  bacteriophage CI repressor  32.81 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 490 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 211 aa  40.8  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  36.84 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  35.48 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0552  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 71 aa  40  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.162215  hitchhiker  0.0000852105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0910  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.85 
 
 		 106 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 273 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 490 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>