More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1543 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 359 aa  733    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1552  hypothetical protein  94.44 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 115 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  29.33 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  26.91 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  23.47 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  26.04 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  29.17 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  25.78 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  43.08 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  41.46 
 
 		 182 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  26.15 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 114 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  29.28 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  31.68 
 
 		 163 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 117 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  31.07 
 
 		 149 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  32.08 
 
 		 149 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  31.13 
 
 		 149 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  25.69 
 
 		 355 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 165 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  26.94 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 149 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  31.07 
 
 		 149 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  25 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0316  helix-turn-helix domain-containing protein  30.61 
 
 		 107 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  40.62 
 
 		 233 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0309  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 107 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.793931  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  27.66 
 
 		 394 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  48.39 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 92 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 128 aa  53.1  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  25.88 
 
 		 372 aa  52.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  28.46 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  26.32 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  40.62 
 
 		 233 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  40.62 
 
 		 233 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 194 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  43.94 
 
 		 71 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 105 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 189 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  37.88 
 
 		 144 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  39.51 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  39.51 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 175 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  23.7 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 262 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  35.62 
 
 		 229 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 139 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 69 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  35.62 
 
 		 229 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 69 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  30.19 
 
 		 149 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 69 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 117 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0045  PbsX family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 117 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 262 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  29.08 
 
 		 165 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 201 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 346 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 106 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  32.17 
 
 		 198 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 195 aa  49.3  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  41.38 
 
 		 143 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 97 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  34.95 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0826  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 446 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 201 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  34.02 
 
 		 256 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 97 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 		 201 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  30.7 
 
 		 262 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  44.12 
 
 		 182 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  24.69 
 
 		 178 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 111 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 145 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  26.02 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  40.32 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 123 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  27.15 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 178 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  36.25 
 
 		 196 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 178 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  38.46 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 171 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  26.35 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  27.15 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 142 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  24.69 
 
 		 185 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 327 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0958  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 132 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  26.63 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>