More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0465 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 163 aa  333  5e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  28.85 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  36.94 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  33.09 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  42.31 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  37.63 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  42.31 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  43.04 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  35.65 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  35.65 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  35.65 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  35.65 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  35.65 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  35.65 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  35.65 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  35.65 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  43.68 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  39.42 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  38.03 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  38.03 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  46.77 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  46.77 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  46.77 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  50.79 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 262 aa  61.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  40.91 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  34.51 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  32.69 
 
 		 369 aa  58.5  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  26.79 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  33.63 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  33.63 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1530  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  41.94 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  38.71 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  30 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  46.03 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  41.89 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  31.31 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  38.36 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  42.62 
 
 		 459 aa  55.1  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  39.66 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  34.44 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  35.8 
 
 		 374 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  37.14 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 395 aa  54.3  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 327 aa  54.3  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  50 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 296 aa  53.9  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 370 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 133 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.1 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  34.57 
 
 		 374 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  34.57 
 
 		 374 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0798  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0286273  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1968  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 257 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  34.57 
 
 		 374 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  40 
 
 		 346 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  38.98 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  32.18 
 
 		 374 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 380 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 273 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  42.62 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 117 aa  52  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>